Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms