Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
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