Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms