Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
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D13Ertd608eQ3UPR8 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
D13Ertd608eQ3UPR8 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
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D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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D13Ertd608eQ3UPR8 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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D13Ertd608eQ3UPR8 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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D13Ertd608eQ3UPR8 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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D13Ertd608eQ3UPR8 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
D13Ertd608eQ3UPR8 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
D13Ertd608eQ3UPR8 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
D13Ertd608eQ3UPR8 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
D13Ertd608eQ3UPR8 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
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D13Ertd608eQ3UPR8 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
D13Ertd608eQ3UPR8 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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D13Ertd608eQ3UPR8 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
D13Ertd608eQ3UPR8 Myo9a-206ENSMUST00000136740 12252 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
D13Ertd608eQ3UPR8 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
D13Ertd608eQ3UPR8 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
D13Ertd608eQ3UPR8 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
D13Ertd608eQ3UPR8 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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D13Ertd608eQ3UPR8 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
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D13Ertd608eQ3UPR8 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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