Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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