Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 AC010326.4-201ENST00000604665 891 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms