Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP4P49662 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP4P49662 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP4P49662 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP4P49662 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP4P49662 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP4P49662 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP4P49662 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP4P49662 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP4P49662 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP4P49662 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP4P49662 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP4P49662 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP4P49662 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP4P49662 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP4P49662 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP4P49662 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP4P49662 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP4P49662 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP4P49662 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP4P49662 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP4P49662 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP4P49662 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP4P49662 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP4P49662 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP4P49662 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP4P49662 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP4P49662 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP4P49662 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP4P49662 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP4P49662 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP4P49662 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP4P49662 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP4P49662 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP4P49662 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP4P49662 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP4P49662 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP4P49662 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP4P49662 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP4P49662 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP4P49662 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP4P49662 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP4P49662 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP4P49662 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP4P49662 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP4P49662 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP4P49662 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP4P49662 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP4P49662 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP4P49662 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP4P49662 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP4P49662 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP4P49662 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP4P49662 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP4P49662 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP4P49662 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP4P49662 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP4P49662 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP4P49662 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP4P49662 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP4P49662 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP4P49662 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP4P49662 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP4P49662 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP4P49662 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP4P49662 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP4P49662 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP4P49662 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP4P49662 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP4P49662 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP4P49662 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP4P49662 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP4P49662 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP4P49662 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP4P49662 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP4P49662 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP4P49662 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP4P49662 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP4P49662 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP4P49662 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP4P49662 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP4P49662 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP4P49662 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP4P49662 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP4P49662 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP4P49662 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP4P49662 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP4P49662 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP4P49662 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP4P49662 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP4P49662 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP4P49662 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP4P49662 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP4P49662 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP4P49662 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP4P49662 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP4P49662 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP4P49662 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP4P49662 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP4P49662 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms