Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP16Q9Y5T5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP16Q9Y5T5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
USP16Q9Y5T5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP16Q9Y5T5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP16Q9Y5T5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP16Q9Y5T5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP16Q9Y5T5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
USP16Q9Y5T5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP16Q9Y5T5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP16Q9Y5T5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP16Q9Y5T5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP16Q9Y5T5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP16Q9Y5T5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP16Q9Y5T5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP16Q9Y5T5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP16Q9Y5T5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
USP16Q9Y5T5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP16Q9Y5T5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP16Q9Y5T5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP16Q9Y5T5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP16Q9Y5T5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP16Q9Y5T5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP16Q9Y5T5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP16Q9Y5T5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP16Q9Y5T5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP16Q9Y5T5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP16Q9Y5T5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP16Q9Y5T5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP16Q9Y5T5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP16Q9Y5T5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP16Q9Y5T5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP16Q9Y5T5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP16Q9Y5T5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP16Q9Y5T5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
USP16Q9Y5T5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP16Q9Y5T5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP16Q9Y5T5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
USP16Q9Y5T5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP16Q9Y5T5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP16Q9Y5T5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP16Q9Y5T5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
USP16Q9Y5T5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
USP16Q9Y5T5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP16Q9Y5T5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP16Q9Y5T5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP16Q9Y5T5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP16Q9Y5T5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP16Q9Y5T5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP16Q9Y5T5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP16Q9Y5T5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP16Q9Y5T5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP16Q9Y5T5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
USP16Q9Y5T5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP16Q9Y5T5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP16Q9Y5T5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP16Q9Y5T5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP16Q9Y5T5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP16Q9Y5T5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
USP16Q9Y5T5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP16Q9Y5T5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
USP16Q9Y5T5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP16Q9Y5T5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP16Q9Y5T5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP16Q9Y5T5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP16Q9Y5T5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP16Q9Y5T5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP16Q9Y5T5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
USP16Q9Y5T5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP16Q9Y5T5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP16Q9Y5T5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP16Q9Y5T5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP16Q9Y5T5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP16Q9Y5T5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP16Q9Y5T5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP16Q9Y5T5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP16Q9Y5T5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP16Q9Y5T5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP16Q9Y5T5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP16Q9Y5T5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP16Q9Y5T5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP16Q9Y5T5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP16Q9Y5T5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP16Q9Y5T5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
USP16Q9Y5T5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP16Q9Y5T5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP16Q9Y5T5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP16Q9Y5T5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP16Q9Y5T5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP16Q9Y5T5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP16Q9Y5T5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP16Q9Y5T5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP16Q9Y5T5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP16Q9Y5T5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP16Q9Y5T5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP16Q9Y5T5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP16Q9Y5T5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
USP16Q9Y5T5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP16Q9Y5T5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP16Q9Y5T5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms