Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C2

TCAF1, TRPM8 channel-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF1Q9Y4C2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms