Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C2

TCAF1, TRPM8 channel-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF1Q9Y4C2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCAF1Q9Y4C2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms