Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
NRXN3Q9Y4C0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
NRXN3Q9Y4C0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NRXN3Q9Y4C0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
NRXN3Q9Y4C0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NRXN3Q9Y4C0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NRXN3Q9Y4C0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NRXN3Q9Y4C0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NRXN3Q9Y4C0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC32.38■■■□□ 2.77
NRXN3Q9Y4C0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
NRXN3Q9Y4C0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NRXN3Q9Y4C0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NRXN3Q9Y4C0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
NRXN3Q9Y4C0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
NRXN3Q9Y4C0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NRXN3Q9Y4C0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NRXN3Q9Y4C0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NRXN3Q9Y4C0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NRXN3Q9Y4C0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NRXN3Q9Y4C0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NRXN3Q9Y4C0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
NRXN3Q9Y4C0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
NRXN3Q9Y4C0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NRXN3Q9Y4C0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
NRXN3Q9Y4C0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NRXN3Q9Y4C0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NRXN3Q9Y4C0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
NRXN3Q9Y4C0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NRXN3Q9Y4C0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NRXN3Q9Y4C0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NRXN3Q9Y4C0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC32.34■■■□□ 2.77
NRXN3Q9Y4C0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
NRXN3Q9Y4C0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
NRXN3Q9Y4C0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NRXN3Q9Y4C0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NRXN3Q9Y4C0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NRXN3Q9Y4C0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NRXN3Q9Y4C0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NRXN3Q9Y4C0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NRXN3Q9Y4C0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NRXN3Q9Y4C0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
NRXN3Q9Y4C0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NRXN3Q9Y4C0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NRXN3Q9Y4C0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NRXN3Q9Y4C0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
NRXN3Q9Y4C0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NRXN3Q9Y4C0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
NRXN3Q9Y4C0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
NRXN3Q9Y4C0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
NRXN3Q9Y4C0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
NRXN3Q9Y4C0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
NRXN3Q9Y4C0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NRXN3Q9Y4C0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NRXN3Q9Y4C0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NRXN3Q9Y4C0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
NRXN3Q9Y4C0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NRXN3Q9Y4C0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NRXN3Q9Y4C0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
NRXN3Q9Y4C0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NRXN3Q9Y4C0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NRXN3Q9Y4C0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
NRXN3Q9Y4C0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NRXN3Q9Y4C0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NRXN3Q9Y4C0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NRXN3Q9Y4C0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NRXN3Q9Y4C0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NRXN3Q9Y4C0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NRXN3Q9Y4C0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NRXN3Q9Y4C0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NRXN3Q9Y4C0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NRXN3Q9Y4C0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NRXN3Q9Y4C0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NRXN3Q9Y4C0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
NRXN3Q9Y4C0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NRXN3Q9Y4C0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NRXN3Q9Y4C0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NRXN3Q9Y4C0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NRXN3Q9Y4C0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NRXN3Q9Y4C0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NRXN3Q9Y4C0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NRXN3Q9Y4C0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NRXN3Q9Y4C0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NRXN3Q9Y4C0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
NRXN3Q9Y4C0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.26■■■□□ 2.76
NRXN3Q9Y4C0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
NRXN3Q9Y4C0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
NRXN3Q9Y4C0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
NRXN3Q9Y4C0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
NRXN3Q9Y4C0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
NRXN3Q9Y4C0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
NRXN3Q9Y4C0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
NRXN3Q9Y4C0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NRXN3Q9Y4C0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
NRXN3Q9Y4C0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
NRXN3Q9Y4C0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NRXN3Q9Y4C0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NRXN3Q9Y4C0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NRXN3Q9Y4C0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NRXN3Q9Y4C0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
NRXN3Q9Y4C0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms