Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CHTOPQ9Y3Y2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHTOPQ9Y3Y2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms