Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CPA4Q9UI42 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CPA4Q9UI42 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CPA4Q9UI42 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CPA4Q9UI42 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CPA4Q9UI42 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CPA4Q9UI42 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CPA4Q9UI42 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CPA4Q9UI42 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CPA4Q9UI42 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CPA4Q9UI42 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CPA4Q9UI42 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CPA4Q9UI42 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CPA4Q9UI42 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CPA4Q9UI42 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CPA4Q9UI42 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CPA4Q9UI42 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
CPA4Q9UI42 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CPA4Q9UI42 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CPA4Q9UI42 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CPA4Q9UI42 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CPA4Q9UI42 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CPA4Q9UI42 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CPA4Q9UI42 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CPA4Q9UI42 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPA4Q9UI42 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPA4Q9UI42 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPA4Q9UI42 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPA4Q9UI42 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPA4Q9UI42 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPA4Q9UI42 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPA4Q9UI42 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CPA4Q9UI42 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CPA4Q9UI42 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CPA4Q9UI42 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CPA4Q9UI42 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CPA4Q9UI42 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CPA4Q9UI42 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CPA4Q9UI42 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CPA4Q9UI42 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CPA4Q9UI42 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CPA4Q9UI42 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CPA4Q9UI42 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CPA4Q9UI42 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CPA4Q9UI42 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CPA4Q9UI42 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CPA4Q9UI42 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CPA4Q9UI42 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CPA4Q9UI42 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CPA4Q9UI42 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CPA4Q9UI42 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CPA4Q9UI42 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CPA4Q9UI42 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CPA4Q9UI42 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CPA4Q9UI42 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CPA4Q9UI42 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CPA4Q9UI42 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CPA4Q9UI42 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CPA4Q9UI42 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CPA4Q9UI42 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CPA4Q9UI42 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CPA4Q9UI42 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CPA4Q9UI42 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CPA4Q9UI42 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CPA4Q9UI42 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CPA4Q9UI42 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CPA4Q9UI42 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CPA4Q9UI42 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CPA4Q9UI42 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CPA4Q9UI42 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CPA4Q9UI42 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CPA4Q9UI42 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CPA4Q9UI42 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CPA4Q9UI42 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CPA4Q9UI42 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CPA4Q9UI42 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CPA4Q9UI42 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CPA4Q9UI42 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CPA4Q9UI42 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CPA4Q9UI42 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CPA4Q9UI42 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CPA4Q9UI42 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CPA4Q9UI42 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CPA4Q9UI42 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CPA4Q9UI42 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CPA4Q9UI42 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CPA4Q9UI42 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CPA4Q9UI42 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CPA4Q9UI42 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CPA4Q9UI42 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CPA4Q9UI42 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CPA4Q9UI42 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CPA4Q9UI42 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPA4Q9UI42 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPA4Q9UI42 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPA4Q9UI42 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPA4Q9UI42 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPA4Q9UI42 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPA4Q9UI42 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPA4Q9UI42 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms