Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP9

SMPX, Small muscular protein, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPXQ9UHP9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SMPXQ9UHP9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMPXQ9UHP9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms