Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MS4A12Q9NXJ0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MS4A12Q9NXJ0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MS4A12Q9NXJ0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MS4A12Q9NXJ0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MS4A12Q9NXJ0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MS4A12Q9NXJ0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MS4A12Q9NXJ0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MS4A12Q9NXJ0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MS4A12Q9NXJ0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MS4A12Q9NXJ0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MS4A12Q9NXJ0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MS4A12Q9NXJ0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MS4A12Q9NXJ0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MS4A12Q9NXJ0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MS4A12Q9NXJ0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MS4A12Q9NXJ0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MS4A12Q9NXJ0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MS4A12Q9NXJ0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MS4A12Q9NXJ0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MS4A12Q9NXJ0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MS4A12Q9NXJ0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MS4A12Q9NXJ0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MS4A12Q9NXJ0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MS4A12Q9NXJ0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MS4A12Q9NXJ0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MS4A12Q9NXJ0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms