Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD7

PARVA, Alpha-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVAQ9NVD7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PARVAQ9NVD7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PARVAQ9NVD7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PARVAQ9NVD7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PARVAQ9NVD7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PARVAQ9NVD7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PARVAQ9NVD7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PARVAQ9NVD7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PARVAQ9NVD7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PARVAQ9NVD7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PARVAQ9NVD7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PARVAQ9NVD7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PARVAQ9NVD7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PARVAQ9NVD7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PARVAQ9NVD7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PARVAQ9NVD7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PARVAQ9NVD7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PARVAQ9NVD7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PARVAQ9NVD7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PARVAQ9NVD7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PARVAQ9NVD7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PARVAQ9NVD7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PARVAQ9NVD7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PARVAQ9NVD7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PARVAQ9NVD7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PARVAQ9NVD7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PARVAQ9NVD7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PARVAQ9NVD7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PARVAQ9NVD7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PARVAQ9NVD7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PARVAQ9NVD7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PARVAQ9NVD7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PARVAQ9NVD7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PARVAQ9NVD7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PARVAQ9NVD7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PARVAQ9NVD7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PARVAQ9NVD7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PARVAQ9NVD7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PARVAQ9NVD7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PARVAQ9NVD7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PARVAQ9NVD7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PARVAQ9NVD7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PARVAQ9NVD7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PARVAQ9NVD7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PARVAQ9NVD7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PARVAQ9NVD7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PARVAQ9NVD7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PARVAQ9NVD7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PARVAQ9NVD7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PARVAQ9NVD7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PARVAQ9NVD7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PARVAQ9NVD7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PARVAQ9NVD7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PARVAQ9NVD7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PARVAQ9NVD7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PARVAQ9NVD7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PARVAQ9NVD7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PARVAQ9NVD7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PARVAQ9NVD7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PARVAQ9NVD7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PARVAQ9NVD7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PARVAQ9NVD7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PARVAQ9NVD7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PARVAQ9NVD7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PARVAQ9NVD7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PARVAQ9NVD7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PARVAQ9NVD7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PARVAQ9NVD7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PARVAQ9NVD7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PARVAQ9NVD7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PARVAQ9NVD7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PARVAQ9NVD7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PARVAQ9NVD7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PARVAQ9NVD7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PARVAQ9NVD7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PARVAQ9NVD7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PARVAQ9NVD7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PARVAQ9NVD7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PARVAQ9NVD7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PARVAQ9NVD7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PARVAQ9NVD7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
PARVAQ9NVD7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PARVAQ9NVD7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PARVAQ9NVD7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PARVAQ9NVD7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PARVAQ9NVD7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PARVAQ9NVD7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PARVAQ9NVD7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PARVAQ9NVD7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PARVAQ9NVD7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PARVAQ9NVD7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PARVAQ9NVD7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PARVAQ9NVD7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PARVAQ9NVD7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PARVAQ9NVD7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PARVAQ9NVD7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PARVAQ9NVD7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PARVAQ9NVD7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PARVAQ9NVD7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PARVAQ9NVD7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms