Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQY0

BIN3, Bridging integrator 3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN3Q9NQY0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BIN3Q9NQY0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BIN3Q9NQY0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BIN3Q9NQY0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BIN3Q9NQY0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BIN3Q9NQY0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BIN3Q9NQY0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BIN3Q9NQY0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BIN3Q9NQY0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BIN3Q9NQY0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BIN3Q9NQY0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BIN3Q9NQY0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BIN3Q9NQY0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BIN3Q9NQY0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BIN3Q9NQY0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BIN3Q9NQY0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BIN3Q9NQY0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BIN3Q9NQY0 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BIN3Q9NQY0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BIN3Q9NQY0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BIN3Q9NQY0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BIN3Q9NQY0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BIN3Q9NQY0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BIN3Q9NQY0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BIN3Q9NQY0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BIN3Q9NQY0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BIN3Q9NQY0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BIN3Q9NQY0 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BIN3Q9NQY0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BIN3Q9NQY0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BIN3Q9NQY0 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BIN3Q9NQY0 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BIN3Q9NQY0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BIN3Q9NQY0 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BIN3Q9NQY0 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BIN3Q9NQY0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BIN3Q9NQY0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BIN3Q9NQY0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BIN3Q9NQY0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BIN3Q9NQY0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BIN3Q9NQY0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BIN3Q9NQY0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BIN3Q9NQY0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BIN3Q9NQY0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BIN3Q9NQY0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BIN3Q9NQY0 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BIN3Q9NQY0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BIN3Q9NQY0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BIN3Q9NQY0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BIN3Q9NQY0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BIN3Q9NQY0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BIN3Q9NQY0 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BIN3Q9NQY0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BIN3Q9NQY0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BIN3Q9NQY0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BIN3Q9NQY0 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BIN3Q9NQY0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BIN3Q9NQY0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BIN3Q9NQY0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BIN3Q9NQY0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BIN3Q9NQY0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BIN3Q9NQY0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms