Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX1

PRDM5, PR domain zinc finger protein 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM5Q9NQX1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRDM5Q9NQX1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRDM5Q9NQX1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRDM5Q9NQX1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDM5Q9NQX1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDM5Q9NQX1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDM5Q9NQX1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDM5Q9NQX1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDM5Q9NQX1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDM5Q9NQX1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDM5Q9NQX1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDM5Q9NQX1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDM5Q9NQX1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDM5Q9NQX1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDM5Q9NQX1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDM5Q9NQX1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDM5Q9NQX1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDM5Q9NQX1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRDM5Q9NQX1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRDM5Q9NQX1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRDM5Q9NQX1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRDM5Q9NQX1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRDM5Q9NQX1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRDM5Q9NQX1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRDM5Q9NQX1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRDM5Q9NQX1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRDM5Q9NQX1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRDM5Q9NQX1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PRDM5Q9NQX1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRDM5Q9NQX1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRDM5Q9NQX1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRDM5Q9NQX1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRDM5Q9NQX1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRDM5Q9NQX1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRDM5Q9NQX1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRDM5Q9NQX1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRDM5Q9NQX1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRDM5Q9NQX1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRDM5Q9NQX1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PRDM5Q9NQX1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRDM5Q9NQX1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRDM5Q9NQX1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRDM5Q9NQX1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRDM5Q9NQX1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDM5Q9NQX1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDM5Q9NQX1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDM5Q9NQX1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDM5Q9NQX1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDM5Q9NQX1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDM5Q9NQX1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDM5Q9NQX1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDM5Q9NQX1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM5Q9NQX1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM5Q9NQX1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM5Q9NQX1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM5Q9NQX1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM5Q9NQX1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM5Q9NQX1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM5Q9NQX1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM5Q9NQX1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM5Q9NQX1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM5Q9NQX1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM5Q9NQX1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM5Q9NQX1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM5Q9NQX1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM5Q9NQX1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM5Q9NQX1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM5Q9NQX1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDM5Q9NQX1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDM5Q9NQX1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDM5Q9NQX1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDM5Q9NQX1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDM5Q9NQX1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDM5Q9NQX1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDM5Q9NQX1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDM5Q9NQX1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDM5Q9NQX1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDM5Q9NQX1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRDM5Q9NQX1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRDM5Q9NQX1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRDM5Q9NQX1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRDM5Q9NQX1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRDM5Q9NQX1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRDM5Q9NQX1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRDM5Q9NQX1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRDM5Q9NQX1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRDM5Q9NQX1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PRDM5Q9NQX1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PRDM5Q9NQX1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PRDM5Q9NQX1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM5Q9NQX1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM5Q9NQX1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM5Q9NQX1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM5Q9NQX1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM5Q9NQX1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM5Q9NQX1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM5Q9NQX1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM5Q9NQX1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM5Q9NQX1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM5Q9NQX1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms