Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RTN4Q9NQC3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RTN4Q9NQC3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RTN4Q9NQC3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RTN4Q9NQC3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RTN4Q9NQC3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RTN4Q9NQC3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RTN4Q9NQC3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RTN4Q9NQC3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RTN4Q9NQC3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RTN4Q9NQC3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RTN4Q9NQC3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RTN4Q9NQC3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RTN4Q9NQC3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RTN4Q9NQC3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RTN4Q9NQC3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RTN4Q9NQC3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RTN4Q9NQC3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RTN4Q9NQC3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RTN4Q9NQC3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RTN4Q9NQC3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RTN4Q9NQC3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RTN4Q9NQC3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RTN4Q9NQC3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RTN4Q9NQC3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RTN4Q9NQC3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RTN4Q9NQC3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RTN4Q9NQC3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RTN4Q9NQC3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RTN4Q9NQC3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RTN4Q9NQC3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RTN4Q9NQC3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RTN4Q9NQC3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RTN4Q9NQC3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RTN4Q9NQC3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RTN4Q9NQC3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RTN4Q9NQC3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RTN4Q9NQC3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RTN4Q9NQC3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RTN4Q9NQC3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RTN4Q9NQC3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RTN4Q9NQC3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RTN4Q9NQC3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RTN4Q9NQC3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RTN4Q9NQC3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RTN4Q9NQC3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RTN4Q9NQC3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RTN4Q9NQC3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RTN4Q9NQC3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RTN4Q9NQC3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RTN4Q9NQC3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RTN4Q9NQC3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RTN4Q9NQC3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RTN4Q9NQC3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RTN4Q9NQC3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RTN4Q9NQC3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RTN4Q9NQC3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RTN4Q9NQC3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RTN4Q9NQC3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RTN4Q9NQC3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RTN4Q9NQC3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RTN4Q9NQC3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RTN4Q9NQC3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RTN4Q9NQC3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RTN4Q9NQC3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RTN4Q9NQC3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RTN4Q9NQC3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RTN4Q9NQC3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RTN4Q9NQC3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RTN4Q9NQC3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RTN4Q9NQC3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RTN4Q9NQC3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RTN4Q9NQC3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RTN4Q9NQC3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RTN4Q9NQC3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RTN4Q9NQC3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RTN4Q9NQC3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RTN4Q9NQC3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RTN4Q9NQC3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RTN4Q9NQC3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RTN4Q9NQC3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
RTN4Q9NQC3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RTN4Q9NQC3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RTN4Q9NQC3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RTN4Q9NQC3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RTN4Q9NQC3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RTN4Q9NQC3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RTN4Q9NQC3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RTN4Q9NQC3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RTN4Q9NQC3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RTN4Q9NQC3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RTN4Q9NQC3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RTN4Q9NQC3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RTN4Q9NQC3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RTN4Q9NQC3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RTN4Q9NQC3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RTN4Q9NQC3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RTN4Q9NQC3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RTN4Q9NQC3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RTN4Q9NQC3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms