Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPJ6

MED4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED4Q9NPJ6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MED4Q9NPJ6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
MED4Q9NPJ6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MED4Q9NPJ6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MED4Q9NPJ6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MED4Q9NPJ6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MED4Q9NPJ6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MED4Q9NPJ6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MED4Q9NPJ6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MED4Q9NPJ6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MED4Q9NPJ6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MED4Q9NPJ6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MED4Q9NPJ6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MED4Q9NPJ6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MED4Q9NPJ6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MED4Q9NPJ6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MED4Q9NPJ6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MED4Q9NPJ6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MED4Q9NPJ6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MED4Q9NPJ6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MED4Q9NPJ6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MED4Q9NPJ6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MED4Q9NPJ6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MED4Q9NPJ6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MED4Q9NPJ6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MED4Q9NPJ6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MED4Q9NPJ6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MED4Q9NPJ6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MED4Q9NPJ6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MED4Q9NPJ6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MED4Q9NPJ6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MED4Q9NPJ6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MED4Q9NPJ6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MED4Q9NPJ6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MED4Q9NPJ6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MED4Q9NPJ6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MED4Q9NPJ6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MED4Q9NPJ6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MED4Q9NPJ6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MED4Q9NPJ6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MED4Q9NPJ6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MED4Q9NPJ6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MED4Q9NPJ6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MED4Q9NPJ6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MED4Q9NPJ6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MED4Q9NPJ6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MED4Q9NPJ6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MED4Q9NPJ6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MED4Q9NPJ6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MED4Q9NPJ6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MED4Q9NPJ6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MED4Q9NPJ6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MED4Q9NPJ6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MED4Q9NPJ6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MED4Q9NPJ6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MED4Q9NPJ6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MED4Q9NPJ6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MED4Q9NPJ6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MED4Q9NPJ6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MED4Q9NPJ6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MED4Q9NPJ6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MED4Q9NPJ6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MED4Q9NPJ6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MED4Q9NPJ6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MED4Q9NPJ6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MED4Q9NPJ6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MED4Q9NPJ6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
MED4Q9NPJ6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MED4Q9NPJ6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MED4Q9NPJ6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MED4Q9NPJ6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MED4Q9NPJ6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MED4Q9NPJ6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MED4Q9NPJ6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MED4Q9NPJ6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MED4Q9NPJ6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MED4Q9NPJ6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MED4Q9NPJ6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MED4Q9NPJ6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MED4Q9NPJ6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MED4Q9NPJ6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MED4Q9NPJ6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MED4Q9NPJ6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MED4Q9NPJ6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MED4Q9NPJ6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MED4Q9NPJ6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MED4Q9NPJ6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MED4Q9NPJ6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MED4Q9NPJ6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MED4Q9NPJ6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MED4Q9NPJ6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MED4Q9NPJ6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MED4Q9NPJ6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MED4Q9NPJ6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MED4Q9NPJ6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MED4Q9NPJ6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MED4Q9NPJ6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MED4Q9NPJ6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MED4Q9NPJ6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MED4Q9NPJ6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms