Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI1

BRD7, Bromodomain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD7Q9NPI1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRD7Q9NPI1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
BRD7Q9NPI1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRD7Q9NPI1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRD7Q9NPI1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRD7Q9NPI1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
BRD7Q9NPI1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BRD7Q9NPI1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRD7Q9NPI1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms