Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00597Q9H2U6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00597Q9H2U6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00597Q9H2U6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00597Q9H2U6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00597Q9H2U6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00597Q9H2U6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00597Q9H2U6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00597Q9H2U6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00597Q9H2U6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00597Q9H2U6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00597Q9H2U6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00597Q9H2U6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00597Q9H2U6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00597Q9H2U6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00597Q9H2U6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00597Q9H2U6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00597Q9H2U6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00597Q9H2U6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00597Q9H2U6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00597Q9H2U6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00597Q9H2U6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00597Q9H2U6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00597Q9H2U6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00597Q9H2U6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00597Q9H2U6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00597Q9H2U6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00597Q9H2U6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00597Q9H2U6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00597Q9H2U6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LINC00597Q9H2U6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LINC00597Q9H2U6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00597Q9H2U6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00597Q9H2U6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00597Q9H2U6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00597Q9H2U6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00597Q9H2U6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00597Q9H2U6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00597Q9H2U6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00597Q9H2U6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00597Q9H2U6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00597Q9H2U6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00597Q9H2U6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00597Q9H2U6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00597Q9H2U6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00597Q9H2U6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00597Q9H2U6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00597Q9H2U6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00597Q9H2U6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00597Q9H2U6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00597Q9H2U6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00597Q9H2U6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00597Q9H2U6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00597Q9H2U6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00597Q9H2U6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00597Q9H2U6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00597Q9H2U6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00597Q9H2U6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00597Q9H2U6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00597Q9H2U6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00597Q9H2U6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00597Q9H2U6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00597Q9H2U6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00597Q9H2U6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00597Q9H2U6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00597Q9H2U6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00597Q9H2U6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00597Q9H2U6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00597Q9H2U6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00597Q9H2U6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00597Q9H2U6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00597Q9H2U6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00597Q9H2U6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00597Q9H2U6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00597Q9H2U6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00597Q9H2U6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00597Q9H2U6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00597Q9H2U6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00597Q9H2U6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00597Q9H2U6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00597Q9H2U6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00597Q9H2U6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00597Q9H2U6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00597Q9H2U6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00597Q9H2U6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00597Q9H2U6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00597Q9H2U6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00597Q9H2U6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC00597Q9H2U6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC00597Q9H2U6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC00597Q9H2U6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC00597Q9H2U6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC00597Q9H2U6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC00597Q9H2U6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC00597Q9H2U6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LINC00597Q9H2U6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LINC00597Q9H2U6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC00597Q9H2U6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC00597Q9H2U6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC00597Q9H2U6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 404.6 ms