Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2F9

CCDC68, Coiled-coil domain-containing protein 68, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC68Q9H2F9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC68Q9H2F9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC68Q9H2F9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC68Q9H2F9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC68Q9H2F9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC68Q9H2F9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC68Q9H2F9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC68Q9H2F9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC68Q9H2F9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC68Q9H2F9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC68Q9H2F9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC68Q9H2F9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC68Q9H2F9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC68Q9H2F9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC68Q9H2F9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC68Q9H2F9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC68Q9H2F9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC68Q9H2F9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC68Q9H2F9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC68Q9H2F9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC68Q9H2F9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC68Q9H2F9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC68Q9H2F9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC68Q9H2F9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC68Q9H2F9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC68Q9H2F9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC68Q9H2F9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC68Q9H2F9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC68Q9H2F9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC68Q9H2F9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC68Q9H2F9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC68Q9H2F9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC68Q9H2F9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC68Q9H2F9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC68Q9H2F9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC68Q9H2F9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC68Q9H2F9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC68Q9H2F9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC68Q9H2F9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC68Q9H2F9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC68Q9H2F9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC68Q9H2F9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC68Q9H2F9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC68Q9H2F9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC68Q9H2F9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC68Q9H2F9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC68Q9H2F9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC68Q9H2F9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC68Q9H2F9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC68Q9H2F9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC68Q9H2F9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC68Q9H2F9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC68Q9H2F9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC68Q9H2F9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC68Q9H2F9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC68Q9H2F9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC68Q9H2F9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC68Q9H2F9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC68Q9H2F9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC68Q9H2F9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC68Q9H2F9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC68Q9H2F9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC68Q9H2F9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC68Q9H2F9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC68Q9H2F9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC68Q9H2F9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC68Q9H2F9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC68Q9H2F9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC68Q9H2F9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC68Q9H2F9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC68Q9H2F9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC68Q9H2F9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC68Q9H2F9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC68Q9H2F9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC68Q9H2F9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC68Q9H2F9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC68Q9H2F9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC68Q9H2F9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC68Q9H2F9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC68Q9H2F9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC68Q9H2F9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC68Q9H2F9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC68Q9H2F9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC68Q9H2F9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC68Q9H2F9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC68Q9H2F9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC68Q9H2F9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC68Q9H2F9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC68Q9H2F9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC68Q9H2F9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC68Q9H2F9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC68Q9H2F9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC68Q9H2F9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC68Q9H2F9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC68Q9H2F9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC68Q9H2F9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC68Q9H2F9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC68Q9H2F9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC68Q9H2F9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC68Q9H2F9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.3 ms