Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMG9Q9H0W8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMG9Q9H0W8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMG9Q9H0W8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMG9Q9H0W8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SMG9Q9H0W8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMG9Q9H0W8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMG9Q9H0W8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMG9Q9H0W8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMG9Q9H0W8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMG9Q9H0W8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMG9Q9H0W8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMG9Q9H0W8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMG9Q9H0W8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMG9Q9H0W8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SMG9Q9H0W8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SMG9Q9H0W8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMG9Q9H0W8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMG9Q9H0W8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SMG9Q9H0W8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMG9Q9H0W8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMG9Q9H0W8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMG9Q9H0W8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMG9Q9H0W8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMG9Q9H0W8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMG9Q9H0W8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMG9Q9H0W8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMG9Q9H0W8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMG9Q9H0W8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMG9Q9H0W8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SMG9Q9H0W8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMG9Q9H0W8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMG9Q9H0W8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMG9Q9H0W8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMG9Q9H0W8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMG9Q9H0W8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMG9Q9H0W8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMG9Q9H0W8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMG9Q9H0W8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMG9Q9H0W8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SMG9Q9H0W8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SMG9Q9H0W8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SMG9Q9H0W8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMG9Q9H0W8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMG9Q9H0W8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMG9Q9H0W8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMG9Q9H0W8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMG9Q9H0W8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SMG9Q9H0W8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMG9Q9H0W8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMG9Q9H0W8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SMG9Q9H0W8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMG9Q9H0W8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMG9Q9H0W8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMG9Q9H0W8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMG9Q9H0W8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SMG9Q9H0W8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SMG9Q9H0W8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMG9Q9H0W8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SMG9Q9H0W8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMG9Q9H0W8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMG9Q9H0W8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMG9Q9H0W8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SMG9Q9H0W8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMG9Q9H0W8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMG9Q9H0W8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMG9Q9H0W8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SMG9Q9H0W8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMG9Q9H0W8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMG9Q9H0W8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMG9Q9H0W8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMG9Q9H0W8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMG9Q9H0W8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMG9Q9H0W8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMG9Q9H0W8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SMG9Q9H0W8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMG9Q9H0W8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMG9Q9H0W8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMG9Q9H0W8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMG9Q9H0W8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMG9Q9H0W8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMG9Q9H0W8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMG9Q9H0W8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMG9Q9H0W8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMG9Q9H0W8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMG9Q9H0W8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMG9Q9H0W8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMG9Q9H0W8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMG9Q9H0W8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMG9Q9H0W8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMG9Q9H0W8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMG9Q9H0W8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMG9Q9H0W8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMG9Q9H0W8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMG9Q9H0W8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMG9Q9H0W8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SMG9Q9H0W8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMG9Q9H0W8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMG9Q9H0W8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMG9Q9H0W8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
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