Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B2

CFAP74, Cilia- and flagella-associated protein 74, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP74Q9C0B2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CFAP74Q9C0B2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CFAP74Q9C0B2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CFAP74Q9C0B2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CFAP74Q9C0B2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CFAP74Q9C0B2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CFAP74Q9C0B2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CFAP74Q9C0B2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CFAP74Q9C0B2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CFAP74Q9C0B2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CFAP74Q9C0B2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CFAP74Q9C0B2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CFAP74Q9C0B2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CFAP74Q9C0B2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CFAP74Q9C0B2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CFAP74Q9C0B2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CFAP74Q9C0B2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CFAP74Q9C0B2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
CFAP74Q9C0B2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CFAP74Q9C0B2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CFAP74Q9C0B2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
CFAP74Q9C0B2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
CFAP74Q9C0B2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CFAP74Q9C0B2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CFAP74Q9C0B2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CFAP74Q9C0B2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CFAP74Q9C0B2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
CFAP74Q9C0B2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
CFAP74Q9C0B2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
CFAP74Q9C0B2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
CFAP74Q9C0B2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
CFAP74Q9C0B2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
CFAP74Q9C0B2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CFAP74Q9C0B2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CFAP74Q9C0B2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CFAP74Q9C0B2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CFAP74Q9C0B2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CFAP74Q9C0B2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CFAP74Q9C0B2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CFAP74Q9C0B2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CFAP74Q9C0B2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CFAP74Q9C0B2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CFAP74Q9C0B2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CFAP74Q9C0B2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
CFAP74Q9C0B2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CFAP74Q9C0B2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CFAP74Q9C0B2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CFAP74Q9C0B2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CFAP74Q9C0B2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CFAP74Q9C0B2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CFAP74Q9C0B2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CFAP74Q9C0B2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CFAP74Q9C0B2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CFAP74Q9C0B2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CFAP74Q9C0B2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CFAP74Q9C0B2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CFAP74Q9C0B2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CFAP74Q9C0B2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CFAP74Q9C0B2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CFAP74Q9C0B2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CFAP74Q9C0B2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CFAP74Q9C0B2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CFAP74Q9C0B2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CFAP74Q9C0B2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CFAP74Q9C0B2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CFAP74Q9C0B2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CFAP74Q9C0B2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
CFAP74Q9C0B2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CFAP74Q9C0B2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CFAP74Q9C0B2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CFAP74Q9C0B2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CFAP74Q9C0B2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CFAP74Q9C0B2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CFAP74Q9C0B2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CFAP74Q9C0B2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
CFAP74Q9C0B2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
CFAP74Q9C0B2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
CFAP74Q9C0B2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
CFAP74Q9C0B2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CFAP74Q9C0B2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CFAP74Q9C0B2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
CFAP74Q9C0B2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CFAP74Q9C0B2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CFAP74Q9C0B2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CFAP74Q9C0B2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
CFAP74Q9C0B2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
CFAP74Q9C0B2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CFAP74Q9C0B2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
CFAP74Q9C0B2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CFAP74Q9C0B2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CFAP74Q9C0B2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CFAP74Q9C0B2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CFAP74Q9C0B2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CFAP74Q9C0B2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CFAP74Q9C0B2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CFAP74Q9C0B2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
CFAP74Q9C0B2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CFAP74Q9C0B2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CFAP74Q9C0B2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CFAP74Q9C0B2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms