Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B1

FTO, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase FTO, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FTOQ9C0B1 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.515e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.467e-11■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 NUTM2A-AS1-202ENST00000413722 732 ntTSL 217.92■□□□□ 0.465e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.455e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.415e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.415e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 TMEM209-204ENST00000471077 585 ntTSL 417.52■□□□□ 0.45e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.395e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.355e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 ORAI2-207ENST00000488996 758 ntTSL 217.2■□□□□ 0.345e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 NUTM2A-AS1-210ENST00000451940 662 ntTSL 516.92■□□□□ 0.35e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 SLC35B1-204ENST00000502406 1477 ntTSL 216.6■□□□□ 0.255e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 LUC7L3-212ENST00000508045 1112 ntTSL 1 (best)16.59■□□□□ 0.255e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 GSR-203ENST00000523295 913 ntTSL 316.32■□□□□ 0.25e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 LUC7L3-206ENST00000504563 840 ntTSL 516.24■□□□□ 0.195e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 BCL7C-203ENST00000572628 1603 ntTSL 1 (best)16.08■□□□□ 0.175e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 LUC7L3-207ENST00000505619 658 ntTSL 315.89■□□□□ 0.135e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.115e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 LUC7L3-214ENST00000508482 1597 ntTSL 215.69■□□□□ 0.12e-25■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.085e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.055e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 NUTM2A-AS1-207ENST00000433920 876 ntTSL 315.2■□□□□ 0.025e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 SLC35B1-205ENST00000503334 943 ntTSL 314.98□□□□□ -0.015e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 LEPR-201ENST00000344610 2935 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.025e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.055e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 NUTM2A-AS1-208ENST00000446751 2394 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.075e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 SLC35B1-206ENST00000504260 2424 ntTSL 214.62□□□□□ -0.075e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 LUC7L3-223ENST00000625349 408 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.115e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 UBE2G1-201ENST00000396981 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.135e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 LUC7L3-213ENST00000508218 533 ntTSL 214.17□□□□□ -0.145e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 LUC7L3-215ENST00000509335 582 ntTSL 213.85□□□□□ -0.195e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 LUC7L3-209ENST00000506686 582 ntTSL 413.85□□□□□ -0.195e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 LEPR-204ENST00000371059 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.235e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 ORAI2-209ENST00000498661 479 ntTSL 1 (best)13.33□□□□□ -0.285e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 IGSF3-202ENST00000369483 7326 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.295e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 RAD51-202ENST00000382643 1588 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.37e-11■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 SLC35B1-211ENST00000508607 529 ntTSL 213.18□□□□□ -0.35e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 HSDL1-207ENST00000568857 549 ntTSL 413.18□□□□□ -0.35e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 IGSF3-203ENST00000369486 7254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.35e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 TRAPPC3-205ENST00000462715 2428 ntTSL 212.66□□□□□ -0.385e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 ORAI2-210ENST00000611770 10679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.465e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 CHTF8-206ENST00000519534 723 ntTSL 212.13□□□□□ -0.475e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 ORAI2-201ENST00000356387 10811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.515e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 AC135048.2-201ENST00000572471 561 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.515e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 SLC35B1-210ENST00000508520 845 ntTSL 511.78□□□□□ -0.525e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 GSR-202ENST00000521479 582 ntTSL 311.64□□□□□ -0.555e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 PLEC-203ENST00000354589 14736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.583e-9■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 SLC35B1-218ENST00000514907 633 ntTSL 510.77□□□□□ -0.695e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 LUC7L3-208ENST00000505658 7040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.692e-25■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 SERPINB9-201ENST00000380698 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.755e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 CDK4-211ENST00000552254 769 ntTSL 210.33□□□□□ -0.765e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 SLC35B1-215ENST00000511657 548 ntTSL 39.63□□□□□ -0.875e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 TRAPPC3-206ENST00000469757 221 ntTSL 29.26□□□□□ -0.935e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 TMEM209-206ENST00000473456 1961 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.975e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 RAD51-206ENST00000527860 566 ntTSL 48.91□□□□□ -0.987e-11■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 LEPR-203ENST00000371058 2805 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.035e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.25e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.215e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.265e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.35e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 TMEM209-205ENST00000471985 571 ntTSL 46.65□□□□□ -1.345e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 LUC7L3-210ENST00000507200 510 ntTSL 43.8□□□□□ -1.85e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.835e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 LZTS2-205ENST00000454422 804 ntTSL 235.7■■■■□ 3.312e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.062e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 LZTS2-207ENST00000489526 802 ntTSL 222.3■■□□□ 1.162e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.122e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 LZTS2-204ENST00000429732 701 ntTSL 520.48■□□□□ 0.872e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 LZTS2-203ENST00000426584 816 ntTSL 318.79■□□□□ 0.62e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 LZTS2-206ENST00000481129 745 ntTSL 316.24■□□□□ 0.192e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.274e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 CXXC5-202ENST00000502295 503 ntTSL 418.86■□□□□ 0.614e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 CXXC5-207ENST00000504944 568 ntTSL 316.15■□□□□ 0.184e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.955e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 PRKCB-210ENST00000498739 569 ntTSL 418.77■□□□□ 0.65e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.045e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.953e-7■■■□□ 14.6
FTOQ9C0B1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.893e-7■■■□□ 14.6
FTOQ9C0B1 SLC35B2-203ENST00000495706 1859 ntTSL 326.25■■□□□ 1.793e-7■■■□□ 14.6
FTOQ9C0B1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.793e-7■■■□□ 14.6
FTOQ9C0B1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.173e-7■■■□□ 14.6
FTOQ9C0B1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.053e-7■■■□□ 14.6
FTOQ9C0B1 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.223e-7■■■□□ 14.6
FTOQ9C0B1 PLCG1-211ENST00000490253 527 ntTSL 220.56■□□□□ 0.883e-6■■■□□ 14.6
FTOQ9C0B1 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.733e-6■■■□□ 14.6
FTOQ9C0B1 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.713e-6■■■□□ 14.6
FTOQ9C0B1 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.752e-6■■□□□ 14.5
FTOQ9C0B1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.955e-15■■□□□ 14.5
FTOQ9C0B1 KRT10-202ENST00000635956 583 ntTSL 224.97■■□□□ 1.595e-15■■□□□ 14.5
FTOQ9C0B1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.11e-8■■□□□ 14.5
FTOQ9C0B1 CDC34-203ENST00000586788 900 ntTSL 228.03■■■□□ 2.081e-8■■□□□ 14.5
FTOQ9C0B1 PHF14-214ENST00000521747 2479 ntTSL 226.92■■□□□ 1.91e-8■■□□□ 14.5
FTOQ9C0B1 PHF14-202ENST00000423760 2627 ntTSL 225.51■■□□□ 1.681e-8■■□□□ 14.5
FTOQ9C0B1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.581e-8■■□□□ 14.5
FTOQ9C0B1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.571e-8■■□□□ 14.5
FTOQ9C0B1 IMPA2-210ENST00000590107 1616 ntTSL 524.83■■□□□ 1.561e-8■■□□□ 14.5
FTOQ9C0B1 IMPA2-202ENST00000383376 1575 ntTSL 1 (best)23.55■■□□□ 1.361e-8■■□□□ 14.5
FTOQ9C0B1 IMPA2-211ENST00000590138 895 ntTSL 523.46■■□□□ 1.351e-8■■□□□ 14.5
FTOQ9C0B1 IMPA2-205ENST00000588752 651 ntTSL 322.99■■□□□ 1.271e-8■■□□□ 14.5
FTOQ9C0B1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.191e-8■■□□□ 14.5
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