Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXQ1Q9C009 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXQ1Q9C009 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXQ1Q9C009 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXQ1Q9C009 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXQ1Q9C009 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXQ1Q9C009 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXQ1Q9C009 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXQ1Q9C009 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXQ1Q9C009 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXQ1Q9C009 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXQ1Q9C009 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXQ1Q9C009 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXQ1Q9C009 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXQ1Q9C009 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXQ1Q9C009 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXQ1Q9C009 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXQ1Q9C009 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXQ1Q9C009 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXQ1Q9C009 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXQ1Q9C009 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXQ1Q9C009 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXQ1Q9C009 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXQ1Q9C009 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXQ1Q9C009 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXQ1Q9C009 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXQ1Q9C009 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXQ1Q9C009 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXQ1Q9C009 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXQ1Q9C009 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXQ1Q9C009 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXQ1Q9C009 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXQ1Q9C009 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXQ1Q9C009 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXQ1Q9C009 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXQ1Q9C009 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXQ1Q9C009 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXQ1Q9C009 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXQ1Q9C009 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXQ1Q9C009 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXQ1Q9C009 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXQ1Q9C009 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXQ1Q9C009 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXQ1Q9C009 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXQ1Q9C009 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXQ1Q9C009 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXQ1Q9C009 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXQ1Q9C009 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXQ1Q9C009 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXQ1Q9C009 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXQ1Q9C009 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXQ1Q9C009 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXQ1Q9C009 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXQ1Q9C009 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXQ1Q9C009 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXQ1Q9C009 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXQ1Q9C009 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXQ1Q9C009 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXQ1Q9C009 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXQ1Q9C009 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXQ1Q9C009 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXQ1Q9C009 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXQ1Q9C009 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXQ1Q9C009 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXQ1Q9C009 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FOXQ1Q9C009 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FOXQ1Q9C009 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FOXQ1Q9C009 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
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FOXQ1Q9C009 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXQ1Q9C009 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXQ1Q9C009 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXQ1Q9C009 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXQ1Q9C009 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXQ1Q9C009 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXQ1Q9C009 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXQ1Q9C009 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXQ1Q9C009 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXQ1Q9C009 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXQ1Q9C009 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXQ1Q9C009 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXQ1Q9C009 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXQ1Q9C009 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXQ1Q9C009 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXQ1Q9C009 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXQ1Q9C009 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXQ1Q9C009 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXQ1Q9C009 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXQ1Q9C009 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXQ1Q9C009 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXQ1Q9C009 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXQ1Q9C009 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXQ1Q9C009 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXQ1Q9C009 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXQ1Q9C009 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXQ1Q9C009 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXQ1Q9C009 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXQ1Q9C009 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXQ1Q9C009 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXQ1Q9C009 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
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