Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY10

SLC46A2, Thymic stromal cotransporter homolog, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A2Q9BY10 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC46A2Q9BY10 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC46A2Q9BY10 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC46A2Q9BY10 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC46A2Q9BY10 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC46A2Q9BY10 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC46A2Q9BY10 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC46A2Q9BY10 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC46A2Q9BY10 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC46A2Q9BY10 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC46A2Q9BY10 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC46A2Q9BY10 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC46A2Q9BY10 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC46A2Q9BY10 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC46A2Q9BY10 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC46A2Q9BY10 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC46A2Q9BY10 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC46A2Q9BY10 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC46A2Q9BY10 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC46A2Q9BY10 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC46A2Q9BY10 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC46A2Q9BY10 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC46A2Q9BY10 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC46A2Q9BY10 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC46A2Q9BY10 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC46A2Q9BY10 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC46A2Q9BY10 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC46A2Q9BY10 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC46A2Q9BY10 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC46A2Q9BY10 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC46A2Q9BY10 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC46A2Q9BY10 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC46A2Q9BY10 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC46A2Q9BY10 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC46A2Q9BY10 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC46A2Q9BY10 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC46A2Q9BY10 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC46A2Q9BY10 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC46A2Q9BY10 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC46A2Q9BY10 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC46A2Q9BY10 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC46A2Q9BY10 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC46A2Q9BY10 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC46A2Q9BY10 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC46A2Q9BY10 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC46A2Q9BY10 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC46A2Q9BY10 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC46A2Q9BY10 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC46A2Q9BY10 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC46A2Q9BY10 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC46A2Q9BY10 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC46A2Q9BY10 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC46A2Q9BY10 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC46A2Q9BY10 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC46A2Q9BY10 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC46A2Q9BY10 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC46A2Q9BY10 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC46A2Q9BY10 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC46A2Q9BY10 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC46A2Q9BY10 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC46A2Q9BY10 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC46A2Q9BY10 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC46A2Q9BY10 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC46A2Q9BY10 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC46A2Q9BY10 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC46A2Q9BY10 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC46A2Q9BY10 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC46A2Q9BY10 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC46A2Q9BY10 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC46A2Q9BY10 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC46A2Q9BY10 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC46A2Q9BY10 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC46A2Q9BY10 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC46A2Q9BY10 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC46A2Q9BY10 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC46A2Q9BY10 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC46A2Q9BY10 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC46A2Q9BY10 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC46A2Q9BY10 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC46A2Q9BY10 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC46A2Q9BY10 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC46A2Q9BY10 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC46A2Q9BY10 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC46A2Q9BY10 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC46A2Q9BY10 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC46A2Q9BY10 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC46A2Q9BY10 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC46A2Q9BY10 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC46A2Q9BY10 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC46A2Q9BY10 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC46A2Q9BY10 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC46A2Q9BY10 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC46A2Q9BY10 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC46A2Q9BY10 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC46A2Q9BY10 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC46A2Q9BY10 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC46A2Q9BY10 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC46A2Q9BY10 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC46A2Q9BY10 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC46A2Q9BY10 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms