Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SPOCK3Q9BQ16 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SPOCK3Q9BQ16 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SPOCK3Q9BQ16 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SPOCK3Q9BQ16 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SPOCK3Q9BQ16 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SPOCK3Q9BQ16 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SPOCK3Q9BQ16 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SPOCK3Q9BQ16 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SPOCK3Q9BQ16 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SPOCK3Q9BQ16 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SPOCK3Q9BQ16 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SPOCK3Q9BQ16 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SPOCK3Q9BQ16 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SPOCK3Q9BQ16 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SPOCK3Q9BQ16 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SPOCK3Q9BQ16 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SPOCK3Q9BQ16 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SPOCK3Q9BQ16 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SPOCK3Q9BQ16 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SPOCK3Q9BQ16 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SPOCK3Q9BQ16 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SPOCK3Q9BQ16 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SPOCK3Q9BQ16 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SPOCK3Q9BQ16 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SPOCK3Q9BQ16 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SPOCK3Q9BQ16 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SPOCK3Q9BQ16 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SPOCK3Q9BQ16 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SPOCK3Q9BQ16 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SPOCK3Q9BQ16 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SPOCK3Q9BQ16 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SPOCK3Q9BQ16 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SPOCK3Q9BQ16 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SPOCK3Q9BQ16 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SPOCK3Q9BQ16 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SPOCK3Q9BQ16 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SPOCK3Q9BQ16 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SPOCK3Q9BQ16 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SPOCK3Q9BQ16 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SPOCK3Q9BQ16 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SPOCK3Q9BQ16 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SPOCK3Q9BQ16 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SPOCK3Q9BQ16 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SPOCK3Q9BQ16 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SPOCK3Q9BQ16 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SPOCK3Q9BQ16 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SPOCK3Q9BQ16 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPOCK3Q9BQ16 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
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