Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPAS2Q99743 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPAS2Q99743 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPAS2Q99743 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPAS2Q99743 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPAS2Q99743 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPAS2Q99743 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPAS2Q99743 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPAS2Q99743 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPAS2Q99743 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPAS2Q99743 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPAS2Q99743 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPAS2Q99743 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPAS2Q99743 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPAS2Q99743 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPAS2Q99743 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPAS2Q99743 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPAS2Q99743 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPAS2Q99743 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPAS2Q99743 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPAS2Q99743 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPAS2Q99743 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPAS2Q99743 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPAS2Q99743 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPAS2Q99743 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPAS2Q99743 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPAS2Q99743 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPAS2Q99743 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPAS2Q99743 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPAS2Q99743 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPAS2Q99743 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPAS2Q99743 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPAS2Q99743 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPAS2Q99743 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPAS2Q99743 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPAS2Q99743 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPAS2Q99743 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NPAS2Q99743 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPAS2Q99743 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPAS2Q99743 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPAS2Q99743 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NPAS2Q99743 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
NPAS2Q99743 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPAS2Q99743 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPAS2Q99743 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPAS2Q99743 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPAS2Q99743 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPAS2Q99743 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPAS2Q99743 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPAS2Q99743 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPAS2Q99743 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPAS2Q99743 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPAS2Q99743 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPAS2Q99743 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPAS2Q99743 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPAS2Q99743 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPAS2Q99743 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPAS2Q99743 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPAS2Q99743 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPAS2Q99743 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPAS2Q99743 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPAS2Q99743 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPAS2Q99743 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPAS2Q99743 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPAS2Q99743 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPAS2Q99743 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPAS2Q99743 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPAS2Q99743 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPAS2Q99743 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPAS2Q99743 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPAS2Q99743 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPAS2Q99743 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPAS2Q99743 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPAS2Q99743 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPAS2Q99743 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPAS2Q99743 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPAS2Q99743 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPAS2Q99743 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NPAS2Q99743 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPAS2Q99743 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NPAS2Q99743 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPAS2Q99743 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPAS2Q99743 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPAS2Q99743 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPAS2Q99743 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPAS2Q99743 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPAS2Q99743 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPAS2Q99743 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPAS2Q99743 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPAS2Q99743 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPAS2Q99743 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPAS2Q99743 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPAS2Q99743 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPAS2Q99743 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPAS2Q99743 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPAS2Q99743 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPAS2Q99743 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPAS2Q99743 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPAS2Q99743 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPAS2Q99743 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms