Protein–RNA interactions for Protein: Q99720

SIGMAR1, Sigma non-opioid intracellular receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGMAR1Q99720 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIGMAR1Q99720 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms