Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM44Q96DX7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM44Q96DX7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM44Q96DX7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM44Q96DX7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM44Q96DX7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM44Q96DX7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM44Q96DX7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM44Q96DX7 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM44Q96DX7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM44Q96DX7 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM44Q96DX7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM44Q96DX7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM44Q96DX7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM44Q96DX7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM44Q96DX7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM44Q96DX7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM44Q96DX7 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM44Q96DX7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM44Q96DX7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM44Q96DX7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM44Q96DX7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM44Q96DX7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM44Q96DX7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM44Q96DX7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM44Q96DX7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM44Q96DX7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM44Q96DX7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM44Q96DX7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM44Q96DX7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM44Q96DX7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM44Q96DX7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM44Q96DX7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM44Q96DX7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM44Q96DX7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM44Q96DX7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM44Q96DX7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM44Q96DX7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM44Q96DX7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM44Q96DX7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM44Q96DX7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM44Q96DX7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM44Q96DX7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM44Q96DX7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM44Q96DX7 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM44Q96DX7 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM44Q96DX7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM44Q96DX7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM44Q96DX7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM44Q96DX7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM44Q96DX7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM44Q96DX7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM44Q96DX7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM44Q96DX7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM44Q96DX7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM44Q96DX7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM44Q96DX7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM44Q96DX7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM44Q96DX7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM44Q96DX7 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM44Q96DX7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM44Q96DX7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM44Q96DX7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM44Q96DX7 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM44Q96DX7 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM44Q96DX7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM44Q96DX7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM44Q96DX7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM44Q96DX7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM44Q96DX7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM44Q96DX7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM44Q96DX7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM44Q96DX7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM44Q96DX7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM44Q96DX7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM44Q96DX7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM44Q96DX7 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM44Q96DX7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM44Q96DX7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM44Q96DX7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TRIM44Q96DX7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TRIM44Q96DX7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM44Q96DX7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM44Q96DX7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM44Q96DX7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM44Q96DX7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM44Q96DX7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM44Q96DX7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM44Q96DX7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM44Q96DX7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM44Q96DX7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM44Q96DX7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM44Q96DX7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM44Q96DX7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM44Q96DX7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM44Q96DX7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM44Q96DX7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM44Q96DX7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM44Q96DX7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM44Q96DX7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms