Protein–RNA interactions for Protein: Q96DN2

VWCE, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWCEQ96DN2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VWCEQ96DN2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VWCEQ96DN2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VWCEQ96DN2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VWCEQ96DN2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VWCEQ96DN2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VWCEQ96DN2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VWCEQ96DN2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VWCEQ96DN2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
VWCEQ96DN2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
VWCEQ96DN2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
VWCEQ96DN2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
VWCEQ96DN2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
VWCEQ96DN2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VWCEQ96DN2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VWCEQ96DN2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VWCEQ96DN2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VWCEQ96DN2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
VWCEQ96DN2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VWCEQ96DN2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
VWCEQ96DN2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VWCEQ96DN2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
VWCEQ96DN2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
VWCEQ96DN2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
VWCEQ96DN2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VWCEQ96DN2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VWCEQ96DN2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VWCEQ96DN2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VWCEQ96DN2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VWCEQ96DN2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VWCEQ96DN2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VWCEQ96DN2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VWCEQ96DN2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VWCEQ96DN2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VWCEQ96DN2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VWCEQ96DN2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VWCEQ96DN2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VWCEQ96DN2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
VWCEQ96DN2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VWCEQ96DN2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VWCEQ96DN2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VWCEQ96DN2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VWCEQ96DN2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VWCEQ96DN2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VWCEQ96DN2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VWCEQ96DN2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VWCEQ96DN2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
VWCEQ96DN2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VWCEQ96DN2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VWCEQ96DN2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VWCEQ96DN2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VWCEQ96DN2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VWCEQ96DN2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VWCEQ96DN2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VWCEQ96DN2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VWCEQ96DN2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VWCEQ96DN2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VWCEQ96DN2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VWCEQ96DN2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VWCEQ96DN2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VWCEQ96DN2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VWCEQ96DN2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
VWCEQ96DN2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
VWCEQ96DN2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VWCEQ96DN2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VWCEQ96DN2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VWCEQ96DN2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VWCEQ96DN2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VWCEQ96DN2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VWCEQ96DN2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VWCEQ96DN2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VWCEQ96DN2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VWCEQ96DN2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VWCEQ96DN2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VWCEQ96DN2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VWCEQ96DN2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VWCEQ96DN2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
VWCEQ96DN2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VWCEQ96DN2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VWCEQ96DN2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VWCEQ96DN2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VWCEQ96DN2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VWCEQ96DN2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VWCEQ96DN2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VWCEQ96DN2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VWCEQ96DN2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VWCEQ96DN2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VWCEQ96DN2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VWCEQ96DN2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VWCEQ96DN2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VWCEQ96DN2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VWCEQ96DN2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VWCEQ96DN2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VWCEQ96DN2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VWCEQ96DN2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VWCEQ96DN2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VWCEQ96DN2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VWCEQ96DN2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VWCEQ96DN2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VWCEQ96DN2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms