Protein–RNA interactions for Protein: Q96CV9

OPTN, Optineurin, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTNQ96CV9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
OPTNQ96CV9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
OPTNQ96CV9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
OPTNQ96CV9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
OPTNQ96CV9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
OPTNQ96CV9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
OPTNQ96CV9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
OPTNQ96CV9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
OPTNQ96CV9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
OPTNQ96CV9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
OPTNQ96CV9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
OPTNQ96CV9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
OPTNQ96CV9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
OPTNQ96CV9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
OPTNQ96CV9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
OPTNQ96CV9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
OPTNQ96CV9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
OPTNQ96CV9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
OPTNQ96CV9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
OPTNQ96CV9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
OPTNQ96CV9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
OPTNQ96CV9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
OPTNQ96CV9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
OPTNQ96CV9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
OPTNQ96CV9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
OPTNQ96CV9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
OPTNQ96CV9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
OPTNQ96CV9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
OPTNQ96CV9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
OPTNQ96CV9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
OPTNQ96CV9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
OPTNQ96CV9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
OPTNQ96CV9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
OPTNQ96CV9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
OPTNQ96CV9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
OPTNQ96CV9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
OPTNQ96CV9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
OPTNQ96CV9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
OPTNQ96CV9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
OPTNQ96CV9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
OPTNQ96CV9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
OPTNQ96CV9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
OPTNQ96CV9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
OPTNQ96CV9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
OPTNQ96CV9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
OPTNQ96CV9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
OPTNQ96CV9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
OPTNQ96CV9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
OPTNQ96CV9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
OPTNQ96CV9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
OPTNQ96CV9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
OPTNQ96CV9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
OPTNQ96CV9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
OPTNQ96CV9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
OPTNQ96CV9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
OPTNQ96CV9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
OPTNQ96CV9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
OPTNQ96CV9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
OPTNQ96CV9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
OPTNQ96CV9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
OPTNQ96CV9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
OPTNQ96CV9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
OPTNQ96CV9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
OPTNQ96CV9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
OPTNQ96CV9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
OPTNQ96CV9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
OPTNQ96CV9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
OPTNQ96CV9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
OPTNQ96CV9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
OPTNQ96CV9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
OPTNQ96CV9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
OPTNQ96CV9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
OPTNQ96CV9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
OPTNQ96CV9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
OPTNQ96CV9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
OPTNQ96CV9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
OPTNQ96CV9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
OPTNQ96CV9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
OPTNQ96CV9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
OPTNQ96CV9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
OPTNQ96CV9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
OPTNQ96CV9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
OPTNQ96CV9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
OPTNQ96CV9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
OPTNQ96CV9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
OPTNQ96CV9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
OPTNQ96CV9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
OPTNQ96CV9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
OPTNQ96CV9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
OPTNQ96CV9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
OPTNQ96CV9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
OPTNQ96CV9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
OPTNQ96CV9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
OPTNQ96CV9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
OPTNQ96CV9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
OPTNQ96CV9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
OPTNQ96CV9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
OPTNQ96CV9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
OPTNQ96CV9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms