Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRF1Q92994 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRF1Q92994 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRF1Q92994 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRF1Q92994 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRF1Q92994 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRF1Q92994 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
BRF1Q92994 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRF1Q92994 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRF1Q92994 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRF1Q92994 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRF1Q92994 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
BRF1Q92994 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRF1Q92994 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRF1Q92994 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRF1Q92994 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRF1Q92994 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRF1Q92994 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRF1Q92994 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
BRF1Q92994 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRF1Q92994 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRF1Q92994 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRF1Q92994 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRF1Q92994 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRF1Q92994 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRF1Q92994 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRF1Q92994 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRF1Q92994 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRF1Q92994 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
BRF1Q92994 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRF1Q92994 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRF1Q92994 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRF1Q92994 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
BRF1Q92994 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BRF1Q92994 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BRF1Q92994 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
BRF1Q92994 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BRF1Q92994 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BRF1Q92994 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BRF1Q92994 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BRF1Q92994 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BRF1Q92994 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRF1Q92994 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRF1Q92994 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRF1Q92994 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRF1Q92994 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRF1Q92994 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRF1Q92994 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRF1Q92994 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRF1Q92994 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
BRF1Q92994 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRF1Q92994 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRF1Q92994 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRF1Q92994 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRF1Q92994 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRF1Q92994 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
BRF1Q92994 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRF1Q92994 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRF1Q92994 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRF1Q92994 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRF1Q92994 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRF1Q92994 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRF1Q92994 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRF1Q92994 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRF1Q92994 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
BRF1Q92994 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRF1Q92994 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRF1Q92994 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRF1Q92994 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
BRF1Q92994 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRF1Q92994 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BRF1Q92994 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BRF1Q92994 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BRF1Q92994 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BRF1Q92994 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BRF1Q92994 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BRF1Q92994 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BRF1Q92994 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BRF1Q92994 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BRF1Q92994 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BRF1Q92994 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BRF1Q92994 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BRF1Q92994 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BRF1Q92994 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BRF1Q92994 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BRF1Q92994 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BRF1Q92994 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BRF1Q92994 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BRF1Q92994 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BRF1Q92994 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BRF1Q92994 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BRF1Q92994 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BRF1Q92994 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
BRF1Q92994 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
BRF1Q92994 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
BRF1Q92994 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BRF1Q92994 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BRF1Q92994 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
BRF1Q92994 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BRF1Q92994 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms