Protein–RNA interactions for Protein: Q92985

IRF7, Interferon regulatory factor 7, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF7Q92985 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRF7Q92985 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRF7Q92985 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRF7Q92985 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRF7Q92985 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRF7Q92985 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRF7Q92985 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRF7Q92985 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRF7Q92985 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRF7Q92985 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRF7Q92985 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRF7Q92985 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRF7Q92985 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRF7Q92985 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRF7Q92985 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
IRF7Q92985 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRF7Q92985 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRF7Q92985 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRF7Q92985 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRF7Q92985 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRF7Q92985 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRF7Q92985 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRF7Q92985 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRF7Q92985 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRF7Q92985 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRF7Q92985 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRF7Q92985 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRF7Q92985 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRF7Q92985 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRF7Q92985 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRF7Q92985 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRF7Q92985 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRF7Q92985 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRF7Q92985 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRF7Q92985 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
IRF7Q92985 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRF7Q92985 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRF7Q92985 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRF7Q92985 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRF7Q92985 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
IRF7Q92985 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRF7Q92985 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRF7Q92985 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRF7Q92985 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF7Q92985 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF7Q92985 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF7Q92985 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF7Q92985 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF7Q92985 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF7Q92985 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF7Q92985 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF7Q92985 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF7Q92985 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF7Q92985 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF7Q92985 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF7Q92985 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF7Q92985 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF7Q92985 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF7Q92985 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF7Q92985 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF7Q92985 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF7Q92985 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRF7Q92985 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRF7Q92985 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRF7Q92985 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRF7Q92985 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRF7Q92985 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRF7Q92985 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRF7Q92985 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
IRF7Q92985 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRF7Q92985 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRF7Q92985 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRF7Q92985 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRF7Q92985 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRF7Q92985 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF7Q92985 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF7Q92985 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF7Q92985 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF7Q92985 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF7Q92985 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF7Q92985 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF7Q92985 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF7Q92985 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF7Q92985 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF7Q92985 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF7Q92985 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF7Q92985 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF7Q92985 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF7Q92985 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF7Q92985 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF7Q92985 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF7Q92985 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF7Q92985 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF7Q92985 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRF7Q92985 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRF7Q92985 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRF7Q92985 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRF7Q92985 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRF7Q92985 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
IRF7Q92985 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms