Protein–RNA interactions for Protein: Q86YC2

PALB2, Partner and localizer of BRCA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALB2Q86YC2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PALB2Q86YC2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PALB2Q86YC2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PALB2Q86YC2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PALB2Q86YC2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PALB2Q86YC2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PALB2Q86YC2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PALB2Q86YC2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PALB2Q86YC2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PALB2Q86YC2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PALB2Q86YC2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PALB2Q86YC2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PALB2Q86YC2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PALB2Q86YC2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PALB2Q86YC2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PALB2Q86YC2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PALB2Q86YC2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PALB2Q86YC2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PALB2Q86YC2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PALB2Q86YC2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PALB2Q86YC2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PALB2Q86YC2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PALB2Q86YC2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PALB2Q86YC2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PALB2Q86YC2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PALB2Q86YC2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PALB2Q86YC2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PALB2Q86YC2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PALB2Q86YC2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PALB2Q86YC2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PALB2Q86YC2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PALB2Q86YC2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PALB2Q86YC2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PALB2Q86YC2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PALB2Q86YC2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PALB2Q86YC2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PALB2Q86YC2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PALB2Q86YC2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PALB2Q86YC2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PALB2Q86YC2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PALB2Q86YC2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PALB2Q86YC2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PALB2Q86YC2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PALB2Q86YC2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PALB2Q86YC2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PALB2Q86YC2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PALB2Q86YC2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PALB2Q86YC2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PALB2Q86YC2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PALB2Q86YC2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PALB2Q86YC2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PALB2Q86YC2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PALB2Q86YC2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PALB2Q86YC2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PALB2Q86YC2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PALB2Q86YC2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PALB2Q86YC2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PALB2Q86YC2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PALB2Q86YC2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PALB2Q86YC2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PALB2Q86YC2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PALB2Q86YC2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PALB2Q86YC2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PALB2Q86YC2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PALB2Q86YC2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PALB2Q86YC2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PALB2Q86YC2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PALB2Q86YC2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PALB2Q86YC2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PALB2Q86YC2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PALB2Q86YC2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PALB2Q86YC2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PALB2Q86YC2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PALB2Q86YC2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PALB2Q86YC2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PALB2Q86YC2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PALB2Q86YC2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PALB2Q86YC2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PALB2Q86YC2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PALB2Q86YC2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PALB2Q86YC2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PALB2Q86YC2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PALB2Q86YC2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PALB2Q86YC2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PALB2Q86YC2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PALB2Q86YC2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PALB2Q86YC2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PALB2Q86YC2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PALB2Q86YC2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PALB2Q86YC2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PALB2Q86YC2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PALB2Q86YC2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PALB2Q86YC2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PALB2Q86YC2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PALB2Q86YC2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PALB2Q86YC2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PALB2Q86YC2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PALB2Q86YC2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PALB2Q86YC2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PALB2Q86YC2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms