Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ANKRD54Q6NXT1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ANKRD54Q6NXT1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ANKRD54Q6NXT1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ANKRD54Q6NXT1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ANKRD54Q6NXT1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ANKRD54Q6NXT1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ANKRD54Q6NXT1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ANKRD54Q6NXT1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ANKRD54Q6NXT1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ANKRD54Q6NXT1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ANKRD54Q6NXT1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ANKRD54Q6NXT1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ANKRD54Q6NXT1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ANKRD54Q6NXT1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ANKRD54Q6NXT1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ANKRD54Q6NXT1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ANKRD54Q6NXT1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ANKRD54Q6NXT1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ANKRD54Q6NXT1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ANKRD54Q6NXT1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ANKRD54Q6NXT1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ANKRD54Q6NXT1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ANKRD54Q6NXT1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ANKRD54Q6NXT1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ANKRD54Q6NXT1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ANKRD54Q6NXT1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ANKRD54Q6NXT1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ANKRD54Q6NXT1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ANKRD54Q6NXT1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ANKRD54Q6NXT1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ANKRD54Q6NXT1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ANKRD54Q6NXT1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ANKRD54Q6NXT1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ANKRD54Q6NXT1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ANKRD54Q6NXT1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ANKRD54Q6NXT1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ANKRD54Q6NXT1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ANKRD54Q6NXT1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ANKRD54Q6NXT1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ANKRD54Q6NXT1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ANKRD54Q6NXT1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ANKRD54Q6NXT1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ANKRD54Q6NXT1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ANKRD54Q6NXT1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ANKRD54Q6NXT1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ANKRD54Q6NXT1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ANKRD54Q6NXT1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ANKRD54Q6NXT1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ANKRD54Q6NXT1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ANKRD54Q6NXT1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ANKRD54Q6NXT1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ANKRD54Q6NXT1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ANKRD54Q6NXT1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ANKRD54Q6NXT1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ANKRD54Q6NXT1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ANKRD54Q6NXT1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ANKRD54Q6NXT1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ANKRD54Q6NXT1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ANKRD54Q6NXT1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ANKRD54Q6NXT1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ANKRD54Q6NXT1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ANKRD54Q6NXT1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ANKRD54Q6NXT1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ANKRD54Q6NXT1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ANKRD54Q6NXT1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ANKRD54Q6NXT1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ANKRD54Q6NXT1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ANKRD54Q6NXT1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ANKRD54Q6NXT1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ANKRD54Q6NXT1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ANKRD54Q6NXT1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ANKRD54Q6NXT1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ANKRD54Q6NXT1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ANKRD54Q6NXT1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ANKRD54Q6NXT1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ANKRD54Q6NXT1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ANKRD54Q6NXT1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ANKRD54Q6NXT1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ANKRD54Q6NXT1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ANKRD54Q6NXT1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ANKRD54Q6NXT1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ANKRD54Q6NXT1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ANKRD54Q6NXT1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ANKRD54Q6NXT1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ANKRD54Q6NXT1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ANKRD54Q6NXT1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ANKRD54Q6NXT1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ANKRD54Q6NXT1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ANKRD54Q6NXT1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ANKRD54Q6NXT1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ANKRD54Q6NXT1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ANKRD54Q6NXT1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ANKRD54Q6NXT1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ANKRD54Q6NXT1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ANKRD54Q6NXT1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ANKRD54Q6NXT1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ANKRD54Q6NXT1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ANKRD54Q6NXT1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ANKRD54Q6NXT1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms