Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCID2Q5JVF3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PCID2Q5JVF3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCID2Q5JVF3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCID2Q5JVF3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCID2Q5JVF3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCID2Q5JVF3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCID2Q5JVF3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCID2Q5JVF3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCID2Q5JVF3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCID2Q5JVF3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCID2Q5JVF3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCID2Q5JVF3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCID2Q5JVF3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCID2Q5JVF3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCID2Q5JVF3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCID2Q5JVF3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCID2Q5JVF3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCID2Q5JVF3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCID2Q5JVF3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCID2Q5JVF3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCID2Q5JVF3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCID2Q5JVF3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCID2Q5JVF3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCID2Q5JVF3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PCID2Q5JVF3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCID2Q5JVF3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCID2Q5JVF3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCID2Q5JVF3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCID2Q5JVF3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCID2Q5JVF3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PCID2Q5JVF3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCID2Q5JVF3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCID2Q5JVF3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCID2Q5JVF3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCID2Q5JVF3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCID2Q5JVF3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCID2Q5JVF3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCID2Q5JVF3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCID2Q5JVF3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCID2Q5JVF3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCID2Q5JVF3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCID2Q5JVF3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCID2Q5JVF3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCID2Q5JVF3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCID2Q5JVF3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCID2Q5JVF3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PCID2Q5JVF3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCID2Q5JVF3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCID2Q5JVF3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PCID2Q5JVF3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCID2Q5JVF3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCID2Q5JVF3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCID2Q5JVF3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCID2Q5JVF3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCID2Q5JVF3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCID2Q5JVF3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCID2Q5JVF3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCID2Q5JVF3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCID2Q5JVF3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCID2Q5JVF3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCID2Q5JVF3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCID2Q5JVF3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCID2Q5JVF3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCID2Q5JVF3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCID2Q5JVF3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCID2Q5JVF3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCID2Q5JVF3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCID2Q5JVF3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PCID2Q5JVF3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCID2Q5JVF3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCID2Q5JVF3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCID2Q5JVF3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCID2Q5JVF3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCID2Q5JVF3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCID2Q5JVF3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCID2Q5JVF3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCID2Q5JVF3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCID2Q5JVF3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCID2Q5JVF3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCID2Q5JVF3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCID2Q5JVF3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PCID2Q5JVF3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCID2Q5JVF3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCID2Q5JVF3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCID2Q5JVF3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCID2Q5JVF3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCID2Q5JVF3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCID2Q5JVF3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCID2Q5JVF3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCID2Q5JVF3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCID2Q5JVF3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PCID2Q5JVF3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCID2Q5JVF3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCID2Q5JVF3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCID2Q5JVF3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCID2Q5JVF3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCID2Q5JVF3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCID2Q5JVF3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCID2Q5JVF3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms