Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHT3

CLEC16A, Protein CLEC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC16AQ2KHT3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLEC16AQ2KHT3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLEC16AQ2KHT3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLEC16AQ2KHT3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLEC16AQ2KHT3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLEC16AQ2KHT3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLEC16AQ2KHT3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLEC16AQ2KHT3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLEC16AQ2KHT3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLEC16AQ2KHT3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLEC16AQ2KHT3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLEC16AQ2KHT3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLEC16AQ2KHT3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLEC16AQ2KHT3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLEC16AQ2KHT3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLEC16AQ2KHT3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLEC16AQ2KHT3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLEC16AQ2KHT3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLEC16AQ2KHT3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLEC16AQ2KHT3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLEC16AQ2KHT3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLEC16AQ2KHT3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLEC16AQ2KHT3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLEC16AQ2KHT3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLEC16AQ2KHT3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLEC16AQ2KHT3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLEC16AQ2KHT3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLEC16AQ2KHT3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CLEC16AQ2KHT3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CLEC16AQ2KHT3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLEC16AQ2KHT3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLEC16AQ2KHT3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CLEC16AQ2KHT3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLEC16AQ2KHT3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLEC16AQ2KHT3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLEC16AQ2KHT3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLEC16AQ2KHT3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLEC16AQ2KHT3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLEC16AQ2KHT3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLEC16AQ2KHT3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLEC16AQ2KHT3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLEC16AQ2KHT3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLEC16AQ2KHT3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CLEC16AQ2KHT3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLEC16AQ2KHT3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLEC16AQ2KHT3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CLEC16AQ2KHT3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLEC16AQ2KHT3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLEC16AQ2KHT3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLEC16AQ2KHT3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLEC16AQ2KHT3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLEC16AQ2KHT3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
CLEC16AQ2KHT3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
CLEC16AQ2KHT3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLEC16AQ2KHT3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLEC16AQ2KHT3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLEC16AQ2KHT3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLEC16AQ2KHT3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLEC16AQ2KHT3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLEC16AQ2KHT3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLEC16AQ2KHT3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLEC16AQ2KHT3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLEC16AQ2KHT3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLEC16AQ2KHT3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLEC16AQ2KHT3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLEC16AQ2KHT3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CLEC16AQ2KHT3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLEC16AQ2KHT3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CLEC16AQ2KHT3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CLEC16AQ2KHT3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CLEC16AQ2KHT3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CLEC16AQ2KHT3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLEC16AQ2KHT3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLEC16AQ2KHT3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CLEC16AQ2KHT3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CLEC16AQ2KHT3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLEC16AQ2KHT3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLEC16AQ2KHT3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLEC16AQ2KHT3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLEC16AQ2KHT3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLEC16AQ2KHT3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLEC16AQ2KHT3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLEC16AQ2KHT3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLEC16AQ2KHT3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLEC16AQ2KHT3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLEC16AQ2KHT3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLEC16AQ2KHT3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLEC16AQ2KHT3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLEC16AQ2KHT3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLEC16AQ2KHT3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLEC16AQ2KHT3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLEC16AQ2KHT3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLEC16AQ2KHT3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLEC16AQ2KHT3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLEC16AQ2KHT3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLEC16AQ2KHT3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLEC16AQ2KHT3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLEC16AQ2KHT3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLEC16AQ2KHT3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLEC16AQ2KHT3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms