Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PMS2P11Q13670 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PMS2P11Q13670 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PMS2P11Q13670 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PMS2P11Q13670 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PMS2P11Q13670 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PMS2P11Q13670 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PMS2P11Q13670 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PMS2P11Q13670 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PMS2P11Q13670 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PMS2P11Q13670 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PMS2P11Q13670 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PMS2P11Q13670 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PMS2P11Q13670 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PMS2P11Q13670 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PMS2P11Q13670 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PMS2P11Q13670 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PMS2P11Q13670 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PMS2P11Q13670 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PMS2P11Q13670 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PMS2P11Q13670 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PMS2P11Q13670 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PMS2P11Q13670 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms