Protein–RNA interactions for Protein: Q12230

LSP1, Sphingolipid long chain base-responsive protein LSP1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSP1Q12230 CBF5YLR175W 1452 nt5.29□□□□□ -1.56
LSP1Q12230 CPR4YCR069W 957 nt5.29□□□□□ -1.56
LSP1Q12230 RRP1YDR087C 837 nt5.29□□□□□ -1.56
LSP1Q12230 YHL049CYHL049C 816 nt5.29□□□□□ -1.56
LSP1Q12230 YOL079WYOL079W 399 nt5.29□□□□□ -1.56
LSP1Q12230 ELC1YPL046C 300 nt5.29□□□□□ -1.56
LSP1Q12230 snR19snR19 568 nt5.29□□□□□ -1.56
LSP1Q12230 CLB4YLR210W 1383 nt5.29□□□□□ -1.56
LSP1Q12230 RPN5YDL147W 1338 nt5.28□□□□□ -1.56
LSP1Q12230 GUS1YGL245W 2127 nt5.28□□□□□ -1.56
LSP1Q12230 YGR291CYGR291C 222 nt5.28□□□□□ -1.56
LSP1Q12230 YPL191CYPL191C 1083 nt5.28□□□□□ -1.56
LSP1Q12230 YBR298C-AYBR298C-A 222 nt5.28□□□□□ -1.56
LSP1Q12230 GAS3YMR215W 1575 nt5.28□□□□□ -1.56
LSP1Q12230 YBR138CYBR138C 1575 nt5.28□□□□□ -1.56
LSP1Q12230 SWC3YAL011W 1878 nt5.28□□□□□ -1.56
LSP1Q12230 THI20YOL055C 1656 nt5.28□□□□□ -1.56
LSP1Q12230 DIT1YDR403W 1611 nt5.27□□□□□ -1.57
LSP1Q12230 ADK2YER170W 678 nt5.27□□□□□ -1.57
LSP1Q12230 COA3YJL062W-A 258 nt5.27□□□□□ -1.57
LSP1Q12230 FMP33YJL161W 543 nt5.27□□□□□ -1.57
LSP1Q12230 YPL113CYPL113C 1191 nt5.27□□□□□ -1.57
LSP1Q12230 ALG5YPL227C 1005 nt5.27□□□□□ -1.57
LSP1Q12230 YCL041CYCL041C 495 nt5.27□□□□□ -1.57
LSP1Q12230 YPL260WYPL260W 1656 nt5.27□□□□□ -1.57
LSP1Q12230 VHC1YBR235W 3363 nt5.26□□□□□ -1.57
LSP1Q12230 YGR266WYGR266W 2106 nt5.26□□□□□ -1.57
LSP1Q12230 GAL4YPL248C 2646 nt5.26□□□□□ -1.57
LSP1Q12230 HOT1YMR172W 2160 nt5.26□□□□□ -1.57
LSP1Q12230 MBP1YDL056W 2502 nt5.25□□□□□ -1.57
LSP1Q12230 HOYDL227C 1761 nt5.25□□□□□ -1.57
LSP1Q12230 DRN1YGR093W 1524 nt5.25□□□□□ -1.57
LSP1Q12230 YLR283WYLR283W 945 nt5.25□□□□□ -1.57
LSP1Q12230 MRPL4YLR439W 960 nt5.25□□□□□ -1.57
LSP1Q12230 YNL228WYNL228W 777 nt5.25□□□□□ -1.57
LSP1Q12230 PHA2YNL316C 1005 nt5.25□□□□□ -1.57
LSP1Q12230 PEX32YBR168W 1242 nt5.25□□□□□ -1.57
LSP1Q12230 ABF1YKL112W 2196 nt5.25□□□□□ -1.57
LSP1Q12230 DBF2YGR092W 1719 nt5.24□□□□□ -1.57
LSP1Q12230 SUR2YDR297W 1050 nt5.24□□□□□ -1.57
LSP1Q12230 MMS21YEL019C 804 nt5.24□□□□□ -1.57
LSP1Q12230 YMR135W-AYMR135W-A 534 nt5.24□□□□□ -1.57
LSP1Q12230 IMD2YHR216W 1572 nt5.24□□□□□ -1.57
LSP1Q12230 GPI18YBR004C 1302 nt5.23□□□□□ -1.57
LSP1Q12230 KIC1YHR102W 3243 nt5.23□□□□□ -1.57
LSP1Q12230 ALG6YOR002W 1635 nt5.23□□□□□ -1.57
LSP1Q12230 PEX22YAL055W 543 nt5.23□□□□□ -1.57
LSP1Q12230 ATG14YBR128C 1035 nt5.23□□□□□ -1.57
LSP1Q12230 BSC5YNR069C 1470 nt5.23□□□□□ -1.57
LSP1Q12230 FRE1YLR214W 2061 nt5.23□□□□□ -1.57
LSP1Q12230 FZO1YBR179C 2568 nt5.23□□□□□ -1.57
LSP1Q12230 GDE1YPL110C 3672 nt5.22□□□□□ -1.57
LSP1Q12230 ESF1YDR365C 1887 nt5.22□□□□□ -1.57
LSP1Q12230 PEX7YDR142C 1128 nt5.22□□□□□ -1.57
LSP1Q12230 LSO1YJR005C-A 282 nt5.22□□□□□ -1.57
LSP1Q12230 YAR030CYAR030C 342 nt5.22□□□□□ -1.57
LSP1Q12230 RFA2YNL312W 822 nt5.22□□□□□ -1.57
LSP1Q12230 HEM15YOR176W 1182 nt5.22□□□□□ -1.57
LSP1Q12230 YCR023CYCR023C 1836 nt5.22□□□□□ -1.57
LSP1Q12230 MPH2YDL247W 1830 nt5.22□□□□□ -1.57
LSP1Q12230 SWI3YJL176C 2478 nt5.21□□□□□ -1.57
LSP1Q12230 PEX30YLR324W 1572 nt5.21□□□□□ -1.57
LSP1Q12230 YFL064CYFL064C 525 nt5.21□□□□□ -1.58
LSP1Q12230 ARO2YGL148W 1131 nt5.21□□□□□ -1.58
LSP1Q12230 KRE9YJL174W 831 nt5.21□□□□□ -1.58
LSP1Q12230 CDC42YLR229C 576 nt5.21□□□□□ -1.58
LSP1Q12230 NPT1YOR209C 1290 nt5.21□□□□□ -1.58
LSP1Q12230 SUA7YPR086W 1038 nt5.21□□□□□ -1.58
LSP1Q12230 YPR202WYPR202W 717 nt5.21□□□□□ -1.58
LSP1Q12230 YMD8YML038C 1329 nt5.21□□□□□ -1.58
LSP1Q12230 YEF1YEL041W 1488 nt5.2□□□□□ -1.58
LSP1Q12230 HRK1YOR267C 2280 nt5.2□□□□□ -1.58
LSP1Q12230 FDC1YDR539W 1512 nt5.2□□□□□ -1.58
LSP1Q12230 YDR056CYDR056C 618 nt5.2□□□□□ -1.58
LSP1Q12230 SAP30YMR263W 606 nt5.2□□□□□ -1.58
LSP1Q12230 GPI12YMR281W 915 nt5.2□□□□□ -1.58
LSP1Q12230 NAT5YOR253W 531 nt5.2□□□□□ -1.58
LSP1Q12230 PCL10YGL134W 1302 nt5.2□□□□□ -1.58
LSP1Q12230 TRM44YPL030W 1704 nt5.2□□□□□ -1.58
LSP1Q12230 XKS1YGR194C 1803 nt5.19□□□□□ -1.58
LSP1Q12230 PTR2YKR093W 1806 nt5.19□□□□□ -1.58
LSP1Q12230 SRG1SRG1 551 nt5.19□□□□□ -1.58
LSP1Q12230 CAB1YDR531W 1104 nt5.19□□□□□ -1.58
LSP1Q12230 YHL034W-AYHL034W-A 462 nt5.19□□□□□ -1.58
LSP1Q12230 DAL3YIR032C 588 nt5.19□□□□□ -1.58
LSP1Q12230 YJL218WYJL218W 591 nt5.19□□□□□ -1.58
LSP1Q12230 NMD3YHR170W 1557 nt5.19□□□□□ -1.58
LSP1Q12230 SAC1YKL212W 1872 nt5.19□□□□□ -1.58
LSP1Q12230 GRC3YLL035W 1899 nt5.19□□□□□ -1.58
LSP1Q12230 PIC2YER053C 903 nt5.18□□□□□ -1.58
LSP1Q12230 YER147C-AYER147C-A 411 nt5.18□□□□□ -1.58
LSP1Q12230 BUR6YER159C 429 nt5.18□□□□□ -1.58
LSP1Q12230 PRM10YJL108C 1152 nt5.18□□□□□ -1.58
LSP1Q12230 ISA1YLL027W 753 nt5.18□□□□□ -1.58
LSP1Q12230 ERG3YLR056W 1098 nt5.18□□□□□ -1.58
LSP1Q12230 REI1YBR267W 1182 nt5.18□□□□□ -1.58
LSP1Q12230 CDC15YAR019C 2925 nt5.18□□□□□ -1.58
LSP1Q12230 URA7YBL039C 1740 nt5.17□□□□□ -1.58
LSP1Q12230 MNN4YKL201C 3537 nt5.17□□□□□ -1.58
LSP1Q12230 BUD13YGL174W 801 nt5.17□□□□□ -1.58
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