Protein–RNA interactions for Protein: Q08409

AUS1, ATP-dependent permease AUS1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AUS1Q08409 SPC105YGL093W 2754 nt5.39□□□□□ -1.55
AUS1Q08409 KRE29YER038C 1395 nt5.39□□□□□ -1.55
AUS1Q08409 YTA6YPL074W 2265 nt5.39□□□□□ -1.55
AUS1Q08409 RSC58YLR033W 1509 nt5.39□□□□□ -1.55
AUS1Q08409 SUP56tL(CAA)A 82 nt5.39□□□□□ -1.55
AUS1Q08409 SUP53tL(CAA)C 82 nt5.39□□□□□ -1.55
AUS1Q08409 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt5.39□□□□□ -1.55
AUS1Q08409 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt5.39□□□□□ -1.55
AUS1Q08409 SUP54tL(CAA)G2 82 nt5.39□□□□□ -1.55
AUS1Q08409 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt5.39□□□□□ -1.55
AUS1Q08409 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt5.39□□□□□ -1.55
AUS1Q08409 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt5.39□□□□□ -1.55
AUS1Q08409 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt5.39□□□□□ -1.55
AUS1Q08409 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt5.39□□□□□ -1.55
AUS1Q08409 MIC26YGR235C 702 nt5.39□□□□□ -1.55
AUS1Q08409 SEC72YLR292C 582 nt5.39□□□□□ -1.55
AUS1Q08409 COG5YNL051W 1212 nt5.39□□□□□ -1.55
AUS1Q08409 SUA7YPR086W 1038 nt5.39□□□□□ -1.55
AUS1Q08409 PEX29YDR479C 1665 nt5.38□□□□□ -1.55
AUS1Q08409 CAF16YFL028C 870 nt5.38□□□□□ -1.55
AUS1Q08409 RDN5-1RDN5-1 121 nt5.38□□□□□ -1.55
AUS1Q08409 RDN5-6RDN5-6 121 nt5.38□□□□□ -1.55
AUS1Q08409 NUP1YOR098C 3231 nt5.37□□□□□ -1.55
AUS1Q08409 MET4YNL103W 2019 nt5.37□□□□□ -1.55
AUS1Q08409 HSP30YCR021C 999 nt5.37□□□□□ -1.55
AUS1Q08409 BUD16YEL029C 939 nt5.37□□□□□ -1.55
AUS1Q08409 BUD13YGL174W 801 nt5.37□□□□□ -1.55
AUS1Q08409 PEP5YMR231W 3090 nt5.36□□□□□ -1.55
AUS1Q08409 ARO80YDR421W 2853 nt5.36□□□□□ -1.55
AUS1Q08409 YDR246W-AYDR246W-A 201 nt5.36□□□□□ -1.55
AUS1Q08409 YPR059CYPR059C 387 nt5.36□□□□□ -1.55
AUS1Q08409 NTA1YJR062C 1374 nt5.36□□□□□ -1.55
AUS1Q08409 RIA1YNL163C 3333 nt5.35□□□□□ -1.55
AUS1Q08409 ARH1YDR376W 1482 nt5.35□□□□□ -1.55
AUS1Q08409 GPP1YIL053W 753 nt5.35□□□□□ -1.55
AUS1Q08409 MID2YLR332W 1131 nt5.35□□□□□ -1.55
AUS1Q08409 HEK2YBL032W 1146 nt5.35□□□□□ -1.55
AUS1Q08409 ELC1YPL046C 300 nt5.35□□□□□ -1.55
AUS1Q08409 HXT17YNR072W 1695 nt5.35□□□□□ -1.55
AUS1Q08409 UBA2YDR390C 1911 nt5.35□□□□□ -1.55
AUS1Q08409 tK(CUU)CtK(CUU)C 73 nt5.34□□□□□ -1.55
AUS1Q08409 tK(CUU)D1tK(CUU)D1 73 nt5.34□□□□□ -1.55
AUS1Q08409 tK(CUU)D2tK(CUU)D2 73 nt5.34□□□□□ -1.55
AUS1Q08409 tK(CUU)E1tK(CUU)E1 73 nt5.34□□□□□ -1.55
AUS1Q08409 tK(CUU)E2tK(CUU)E2 73 nt5.34□□□□□ -1.55
AUS1Q08409 tK(CUU)FtK(CUU)F 73 nt5.34□□□□□ -1.55
AUS1Q08409 tK(CUU)G1tK(CUU)G1 73 nt5.34□□□□□ -1.55
AUS1Q08409 tK(CUU)G2tK(CUU)G2 73 nt5.34□□□□□ -1.55
AUS1Q08409 tK(CUU)G3tK(CUU)G3 73 nt5.34□□□□□ -1.55
AUS1Q08409 tK(CUU)ItK(CUU)I 73 nt5.34□□□□□ -1.55
AUS1Q08409 tK(CUU)JtK(CUU)J 73 nt5.34□□□□□ -1.55
AUS1Q08409 tK(CUU)KtK(CUU)K 73 nt5.34□□□□□ -1.55
AUS1Q08409 tK(CUU)MtK(CUU)M 73 nt5.34□□□□□ -1.55
AUS1Q08409 tK(CUU)PtK(CUU)P 73 nt5.34□□□□□ -1.55
AUS1Q08409 YJR038CYJR038C 363 nt5.34□□□□□ -1.55
AUS1Q08409 YML116W-AYML116W-A 303 nt5.34□□□□□ -1.55
AUS1Q08409 DSC2YOL073C 969 nt5.34□□□□□ -1.55
AUS1Q08409 VPS69YPR087W 321 nt5.34□□□□□ -1.55
AUS1Q08409 DUR1,2YBR208C 5508 nt5.34□□□□□ -1.55
AUS1Q08409 BUD14YAR014C 2130 nt5.34□□□□□ -1.56
AUS1Q08409 DNF2YDR093W 4839 nt5.33□□□□□ -1.56
AUS1Q08409 NUP2YLR335W 2163 nt5.33□□□□□ -1.56
AUS1Q08409 YFT2YDR319C 825 nt5.33□□□□□ -1.56
AUS1Q08409 YEL045CYEL045C 426 nt5.33□□□□□ -1.56
AUS1Q08409 AAD6YFL056C 639 nt5.33□□□□□ -1.56
AUS1Q08409 YGL088WYGL088W 366 nt5.33□□□□□ -1.56
AUS1Q08409 YGL152CYGL152C 678 nt5.33□□□□□ -1.56
AUS1Q08409 RAD27YKL113C 1149 nt5.33□□□□□ -1.56
AUS1Q08409 ARC40YBR234C 1155 nt5.33□□□□□ -1.56
AUS1Q08409 BUD8YLR353W 1812 nt5.33□□□□□ -1.56
AUS1Q08409 HXT7YDR342C 1713 nt5.32□□□□□ -1.56
AUS1Q08409 HXT6YDR343C 1713 nt5.32□□□□□ -1.56
AUS1Q08409 PAP1YKR002W 1707 nt5.32□□□□□ -1.56
AUS1Q08409 PTC1YDL006W 846 nt5.31□□□□□ -1.56
AUS1Q08409 NUP42YDR192C 1293 nt5.31□□□□□ -1.56
AUS1Q08409 YNL194CYNL194C 906 nt5.31□□□□□ -1.56
AUS1Q08409 TKL1YPR074C 2043 nt5.31□□□□□ -1.56
AUS1Q08409 YDR056CYDR056C 618 nt5.3□□□□□ -1.56
AUS1Q08409 HGH1YGR187C 1185 nt5.3□□□□□ -1.56
AUS1Q08409 YAR030CYAR030C 342 nt5.3□□□□□ -1.56
AUS1Q08409 TAF11YML015C 1041 nt5.3□□□□□ -1.56
AUS1Q08409 HLJ1YMR161W 675 nt5.3□□□□□ -1.56
AUS1Q08409 CKA2YOR061W 1020 nt5.3□□□□□ -1.56
AUS1Q08409 ADE6YGR061C 4077 nt5.3□□□□□ -1.56
AUS1Q08409 LAS1YKR063C 1509 nt5.3□□□□□ -1.56
AUS1Q08409 IGO2YHR132W-A 396 nt5.29□□□□□ -1.56
AUS1Q08409 UTP11YKL099C 753 nt5.29□□□□□ -1.56
AUS1Q08409 SNF8YPL002C 702 nt5.29□□□□□ -1.56
AUS1Q08409 ATH1YPR026W 3636 nt5.29□□□□□ -1.56
AUS1Q08409 CWH43YCR017C 2862 nt5.29□□□□□ -1.56
AUS1Q08409 CDC48YDL126C 2508 nt5.29□□□□□ -1.56
AUS1Q08409 KCC4YCL024W 3114 nt5.29□□□□□ -1.56
AUS1Q08409 COG1YGL223C 1254 nt5.29□□□□□ -1.56
AUS1Q08409 FUR1YHR128W 651 nt5.29□□□□□ -1.56
AUS1Q08409 YKE4YIL023C 1041 nt5.29□□□□□ -1.56
AUS1Q08409 YIM1YMR152W 1098 nt5.29□□□□□ -1.56
AUS1Q08409 ABF1YKL112W 2196 nt5.28□□□□□ -1.56
AUS1Q08409 YGR125WYGR125W 3111 nt5.28□□□□□ -1.56
AUS1Q08409 PRD1YCL057W 2139 nt5.28□□□□□ -1.56
AUS1Q08409 CTT1YGR088W 1689 nt5.28□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 25.7 ms