Protein–RNA interactions for Protein: Q05900

YHC1, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHC1Q05900 ARC40YBR234C 1155 nt4.41□□□□□ -1.7
YHC1Q05900 SFI1YLL003W 2841 nt4.4□□□□□ -1.7
YHC1Q05900 SLD2YKL108W 1362 nt4.4□□□□□ -1.7
YHC1Q05900 MDR1YGR100W 2853 nt4.4□□□□□ -1.7
YHC1Q05900 MMS21YEL019C 804 nt4.4□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 RIP1YEL024W 648 nt4.4□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 AAD6YFL056C 639 nt4.4□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 MRPL39YML009C 213 nt4.4□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 AIF1YNR074C 1137 nt4.4□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 TGS1YPL157W 948 nt4.4□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 MRE11YMR224C 2079 nt4.4□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 SWI3YJL176C 2478 nt4.4□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 YER158CYER158C 1722 nt4.4□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 STE12YHR084W 2067 nt4.39□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 HIR2YOR038C 2628 nt4.39□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 ARG82YDR173C 1068 nt4.39□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 SNA2YDR525W-A 240 nt4.39□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 RPL34AYER056C-A 366 nt4.39□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 YGR066CYGR066C 879 nt4.39□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 YJR012CYJR012C 624 nt4.39□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 YAL047W-AYAL047W-A 330 nt4.39□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 MAC1YMR021C 1254 nt4.39□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 RPC19YNL113W 429 nt4.39□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 BUD17YNR027W 954 nt4.39□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 HSP26YBR072W 645 nt4.39□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 YCL021W-AYCL021W-A 378 nt4.39□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 KAP114YGL241W 3015 nt4.39□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 ARN2YHL047C 1863 nt4.39□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 IML2YJL082W 2196 nt4.38□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 AIM10YER087W 1731 nt4.38□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 ASP1YDR321W 1146 nt4.38□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 ISY1YJR050W 708 nt4.38□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 NMA1YLR328W 1206 nt4.38□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 TOM40YMR203W 1164 nt4.38□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 YPL071CYPL071C 471 nt4.38□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 ATG14YBR128C 1035 nt4.38□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 MSC7YHR039C 1935 nt4.38□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 PAH1YMR165C 2589 nt4.38□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 PXA1YPL147W 2613 nt4.38□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 ATH1YPR026W 3636 nt4.38□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 SPO77YLR341W 1434 nt4.38□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 CTS2YDR371W 1536 nt4.37□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 TUL1YKL034W 2277 nt4.37□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 YDL027CYDL027C 1263 nt4.37□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 tK(CUU)CtK(CUU)C 73 nt4.37□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 tK(CUU)D1tK(CUU)D1 73 nt4.37□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 tK(CUU)D2tK(CUU)D2 73 nt4.37□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 tK(CUU)E1tK(CUU)E1 73 nt4.37□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 tK(CUU)E2tK(CUU)E2 73 nt4.37□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 tK(CUU)FtK(CUU)F 73 nt4.37□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 tK(CUU)G1tK(CUU)G1 73 nt4.37□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 tK(CUU)G2tK(CUU)G2 73 nt4.37□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 tK(CUU)G3tK(CUU)G3 73 nt4.37□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 tK(CUU)ItK(CUU)I 73 nt4.37□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 tK(CUU)JtK(CUU)J 73 nt4.37□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 tK(CUU)KtK(CUU)K 73 nt4.37□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 tK(CUU)MtK(CUU)M 73 nt4.37□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 tK(CUU)PtK(CUU)P 73 nt4.37□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 GPP1YIL053W 753 nt4.37□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 YPL014WYPL014W 1146 nt4.37□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 GRE1YPL223C 507 nt4.37□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 UMP1YBR173C 447 nt4.37□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 AFT1YGL071W 2073 nt4.37□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 CLD1YGR110W 1338 nt4.37□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 SAP4YGL229C 2457 nt4.37□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 CBF5YLR175W 1452 nt4.37□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 EAR1YMR171C 1653 nt4.36□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 SNF3YDL194W 2655 nt4.36□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 ARF2YDL137W 546 nt4.36□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 YKL107WYKL107W 930 nt4.36□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 MID2YLR332W 1131 nt4.36□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 YMR030W-AYMR030W-A 291 nt4.36□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 PRD1YCL057W 2139 nt4.36□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 APE1YKL103C 1545 nt4.36□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 CAB3YKL088W 1716 nt4.35□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 SWC3YAL011W 1878 nt4.35□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 TYW3YGL050W 822 nt4.35□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 MMS2YGL087C 414 nt4.35□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 NAT2YGR147C 867 nt4.35□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 CAB4YGR277C 918 nt4.35□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 CPR6YLR216C 1116 nt4.35□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 YIF1YNL263C 945 nt4.35□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 ARG8YOL140W 1272 nt4.35□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 UBA3YPR066W 900 nt4.35□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 HOT1YMR172W 2160 nt4.35□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 NMD3YHR170W 1557 nt4.35□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 GIP2YER054C 1647 nt4.35□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 MSC2YDR205W 2175 nt4.34□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 YDL012CYDL012C 324 nt4.34□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 UBC6YER100W 753 nt4.34□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 SCS2YER120W 735 nt4.34□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 PDE1YGL248W 1110 nt4.34□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 COA3YJL062W-A 258 nt4.34□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 MNN11YJL183W 1269 nt4.34□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 TVP38YKR088C 1014 nt4.34□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 FBP1YLR377C 1047 nt4.34□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 YPL113CYPL113C 1191 nt4.34□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 IMA3YIL172C 1770 nt4.34□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 IMA4YJL221C 1770 nt4.34□□□□□ -1.71
YHC1Q05900 MPP10YJR002W 1782 nt4.34□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.1 ms