Protein–RNA interactions for Protein: Q04217

ECM16, Probable ATP-dependent RNA helicase DHR1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ECM16Q04217 MMS2YGL087C 414 nt5.91□□□□□ -1.46
ECM16Q04217 YJR085CYJR085C 318 nt5.91□□□□□ -1.46
ECM16Q04217 UGA2YBR006W 1494 nt5.9□□□□□ -1.46
ECM16Q04217 PAD1YDR538W 729 nt5.9□□□□□ -1.46
ECM16Q04217 YAL044W-AYAL044W-A 333 nt5.9□□□□□ -1.46
ECM16Q04217 YAL056C-AYAL056C-A 351 nt5.9□□□□□ -1.46
ECM16Q04217 NCE103YNL036W 666 nt5.9□□□□□ -1.46
ECM16Q04217 YCL012CYCL012C 405 nt5.9□□□□□ -1.46
ECM16Q04217 TMN2YDR107C 2019 nt5.9□□□□□ -1.47
ECM16Q04217 HXT4YHR092C 1731 nt5.9□□□□□ -1.47
ECM16Q04217 TUP1YCR084C 2142 nt5.9□□□□□ -1.47
ECM16Q04217 MKS1YNL076W 1755 nt5.9□□□□□ -1.47
ECM16Q04217 PEX19YDL065C 1029 nt5.89□□□□□ -1.47
ECM16Q04217 FAU1YER183C 636 nt5.89□□□□□ -1.47
ECM16Q04217 ZRC1YMR243C 1329 nt5.89□□□□□ -1.47
ECM16Q04217 MMT2YPL224C 1455 nt5.89□□□□□ -1.47
ECM16Q04217 DNF2YDR093W 4839 nt5.88□□□□□ -1.47
ECM16Q04217 YER085CYER085C 522 nt5.88□□□□□ -1.47
ECM16Q04217 MOB2YFL034C-B 864 nt5.88□□□□□ -1.47
ECM16Q04217 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt5.88□□□□□ -1.47
ECM16Q04217 YLR124WYLR124W 345 nt5.88□□□□□ -1.47
ECM16Q04217 PPA2YMR267W 933 nt5.88□□□□□ -1.47
ECM16Q04217 CKB2YOR039W 777 nt5.88□□□□□ -1.47
ECM16Q04217 SEC39YLR440C 2130 nt5.87□□□□□ -1.47
ECM16Q04217 MRPL7YDR237W 879 nt5.87□□□□□ -1.47
ECM16Q04217 YER187WYER187W 426 nt5.87□□□□□ -1.47
ECM16Q04217 ERV14YGL054C 417 nt5.87□□□□□ -1.47
ECM16Q04217 CUE5YOR042W 1236 nt5.87□□□□□ -1.47
ECM16Q04217 YPL073CYPL073C 486 nt5.87□□□□□ -1.47
ECM16Q04217 NAT3YPR131C 588 nt5.87□□□□□ -1.47
ECM16Q04217 CDC28YBR160W 897 nt5.87□□□□□ -1.47
ECM16Q04217 HST1YOL068C 1512 nt5.86□□□□□ -1.47
ECM16Q04217 ARG4YHR018C 1392 nt5.86□□□□□ -1.47
ECM16Q04217 CNL1YDR357C 369 nt5.86□□□□□ -1.47
ECM16Q04217 GPR1YDL035C 2886 nt5.86□□□□□ -1.47
ECM16Q04217 PXA1YPL147W 2613 nt5.86□□□□□ -1.47
ECM16Q04217 GAS2YLR343W 1668 nt5.85□□□□□ -1.47
ECM16Q04217 EKI1YDR147W 1605 nt5.85□□□□□ -1.47
ECM16Q04217 IMD3YLR432W 1572 nt5.85□□□□□ -1.47
ECM16Q04217 YEL067CYEL067C 588 nt5.85□□□□□ -1.47
ECM16Q04217 YFR035CYFR035C 345 nt5.85□□□□□ -1.47
ECM16Q04217 GAT3YLR013W 426 nt5.85□□□□□ -1.47
ECM16Q04217 SNO1YMR095C 675 nt5.85□□□□□ -1.47
ECM16Q04217 YGP1YNL160W 1065 nt5.85□□□□□ -1.47
ECM16Q04217 SAS10YDL153C 1833 nt5.85□□□□□ -1.47
ECM16Q04217 ERG4YGL012W 1422 nt5.84□□□□□ -1.47
ECM16Q04217 MST1YKL194C 1389 nt5.84□□□□□ -1.47
ECM16Q04217 DEG1YFL001W 1329 nt5.84□□□□□ -1.47
ECM16Q04217 UBC1YDR177W 648 nt5.84□□□□□ -1.47
ECM16Q04217 YEL053W-AYEL053W-A 348 nt5.84□□□□□ -1.47
ECM16Q04217 YKR075CYKR075C 924 nt5.84□□□□□ -1.47
ECM16Q04217 CTF18YMR078C 2226 nt5.84□□□□□ -1.47
ECM16Q04217 YMR102CYMR102C 2505 nt5.84□□□□□ -1.47
ECM16Q04217 TUB2YFL037W 1374 nt5.83□□□□□ -1.48
ECM16Q04217 TRM8YDL201W 861 nt5.83□□□□□ -1.48
ECM16Q04217 NVJ1YHR195W 966 nt5.83□□□□□ -1.48
ECM16Q04217 MDG1YNL173C 1101 nt5.83□□□□□ -1.48
ECM16Q04217 NAT5YOR253W 531 nt5.83□□□□□ -1.48
ECM16Q04217 SVF1YDR346C 1446 nt5.82□□□□□ -1.48
ECM16Q04217 CAB3YKL088W 1716 nt5.82□□□□□ -1.48
ECM16Q04217 LHP1YDL051W 828 nt5.82□□□□□ -1.48
ECM16Q04217 GCV1YDR019C 1203 nt5.82□□□□□ -1.48
ECM16Q04217 YNL174WYNL174W 573 nt5.82□□□□□ -1.48
ECM16Q04217 NHP6AYPR052C 282 nt5.82□□□□□ -1.48
ECM16Q04217 HRR25YPL204W 1485 nt5.82□□□□□ -1.48
ECM16Q04217 TFG1YGR186W 2208 nt5.82□□□□□ -1.48
ECM16Q04217 TOS3YGL179C 1683 nt5.82□□□□□ -1.48
ECM16Q04217 PAL1YDR348C 1500 nt5.81□□□□□ -1.48
ECM16Q04217 AIR2YDL175C 1035 nt5.81□□□□□ -1.48
ECM16Q04217 AUA1YFL010W-A 285 nt5.81□□□□□ -1.48
ECM16Q04217 ECT1YGR007W 972 nt5.81□□□□□ -1.48
ECM16Q04217 PCT1YGR202C 1275 nt5.81□□□□□ -1.48
ECM16Q04217 LNP1YHR192W 837 nt5.81□□□□□ -1.48
ECM16Q04217 YLL017WYLL017W 312 nt5.81□□□□□ -1.48
ECM16Q04217 CUS2YNL286W 858 nt5.81□□□□□ -1.48
ECM16Q04217 SER33YIL074C 1410 nt5.81□□□□□ -1.48
ECM16Q04217 DAL81YIR023W 2913 nt5.81□□□□□ -1.48
ECM16Q04217 BDP1YNL039W 1785 nt5.8□□□□□ -1.48
ECM16Q04217 GAS5YOL030W 1455 nt5.8□□□□□ -1.48
ECM16Q04217 YML057C-AYML057C-A 390 nt5.8□□□□□ -1.48
ECM16Q04217 YET2YMR040W 483 nt5.8□□□□□ -1.48
ECM16Q04217 TRS33YOR115C 807 nt5.8□□□□□ -1.48
ECM16Q04217 NOP16YER002W 696 nt5.79□□□□□ -1.48
ECM16Q04217 TIM21YGR033C 720 nt5.79□□□□□ -1.48
ECM16Q04217 YNG1YOR064C 660 nt5.79□□□□□ -1.48
ECM16Q04217 AIM10YER087W 1731 nt5.79□□□□□ -1.48
ECM16Q04217 HER2YMR293C 1395 nt5.79□□□□□ -1.48
ECM16Q04217 ALG2YGL065C 1512 nt5.79□□□□□ -1.48
ECM16Q04217 YER133W-AYER133W-A 342 nt5.78□□□□□ -1.48
ECM16Q04217 KTR7YIL085C 1554 nt5.78□□□□□ -1.48
ECM16Q04217 YLR402WYLR402W 192 nt5.78□□□□□ -1.48
ECM16Q04217 TDA11YHR159W 1515 nt5.78□□□□□ -1.48
ECM16Q04217 PDR10YOR328W 4695 nt5.78□□□□□ -1.48
ECM16Q04217 PRP43YGL120C 2304 nt5.77□□□□□ -1.49
ECM16Q04217 NFI1YOR156C 2181 nt5.77□□□□□ -1.49
ECM16Q04217 UTP6YDR449C 1323 nt5.77□□□□□ -1.49
ECM16Q04217 CAF16YFL028C 870 nt5.77□□□□□ -1.49
ECM16Q04217 YNG2YHR090C 849 nt5.77□□□□□ -1.49
ECM16Q04217 TPP1YMR156C 717 nt5.77□□□□□ -1.49
ECM16Q04217 MFA2YNL145W 117 nt5.77□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 37.3 ms