Protein–RNA interactions for Protein: P63316

TNNC1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNC1P63316 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNNC1P63316 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNNC1P63316 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNNC1P63316 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNNC1P63316 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNNC1P63316 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNNC1P63316 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNNC1P63316 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNNC1P63316 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNNC1P63316 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNNC1P63316 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNNC1P63316 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNNC1P63316 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNNC1P63316 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNNC1P63316 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNNC1P63316 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNNC1P63316 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNNC1P63316 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNC1P63316 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNC1P63316 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNC1P63316 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNC1P63316 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNC1P63316 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNC1P63316 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNC1P63316 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNC1P63316 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNC1P63316 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNC1P63316 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNC1P63316 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNC1P63316 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNC1P63316 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNC1P63316 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNC1P63316 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNC1P63316 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNC1P63316 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNC1P63316 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNC1P63316 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNC1P63316 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNC1P63316 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNC1P63316 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNC1P63316 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNC1P63316 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNC1P63316 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNC1P63316 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNC1P63316 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNC1P63316 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNC1P63316 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNC1P63316 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNC1P63316 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNC1P63316 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNC1P63316 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNC1P63316 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNC1P63316 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNC1P63316 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNC1P63316 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNC1P63316 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNC1P63316 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNC1P63316 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNC1P63316 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNC1P63316 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNC1P63316 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNC1P63316 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNC1P63316 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNC1P63316 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNC1P63316 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNC1P63316 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNC1P63316 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNC1P63316 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNC1P63316 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNC1P63316 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNC1P63316 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNC1P63316 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNC1P63316 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNC1P63316 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNC1P63316 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNC1P63316 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNC1P63316 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNC1P63316 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNC1P63316 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNC1P63316 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNC1P63316 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms