Protein–RNA interactions for Protein: P55344

LIM2, Lens fiber membrane intrinsic protein, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIM2P55344 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIM2P55344 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIM2P55344 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIM2P55344 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIM2P55344 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIM2P55344 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIM2P55344 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIM2P55344 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LIM2P55344 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LIM2P55344 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LIM2P55344 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LIM2P55344 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LIM2P55344 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIM2P55344 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIM2P55344 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIM2P55344 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIM2P55344 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIM2P55344 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIM2P55344 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIM2P55344 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIM2P55344 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIM2P55344 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIM2P55344 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIM2P55344 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIM2P55344 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIM2P55344 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIM2P55344 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIM2P55344 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIM2P55344 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIM2P55344 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LIM2P55344 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LIM2P55344 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LIM2P55344 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LIM2P55344 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LIM2P55344 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LIM2P55344 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LIM2P55344 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LIM2P55344 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LIM2P55344 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LIM2P55344 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LIM2P55344 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LIM2P55344 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LIM2P55344 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LIM2P55344 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LIM2P55344 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LIM2P55344 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LIM2P55344 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LIM2P55344 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LIM2P55344 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LIM2P55344 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LIM2P55344 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LIM2P55344 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LIM2P55344 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LIM2P55344 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LIM2P55344 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LIM2P55344 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LIM2P55344 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LIM2P55344 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LIM2P55344 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LIM2P55344 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LIM2P55344 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LIM2P55344 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LIM2P55344 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LIM2P55344 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LIM2P55344 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LIM2P55344 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LIM2P55344 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LIM2P55344 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIM2P55344 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIM2P55344 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIM2P55344 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIM2P55344 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIM2P55344 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LIM2P55344 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIM2P55344 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIM2P55344 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIM2P55344 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIM2P55344 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIM2P55344 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIM2P55344 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIM2P55344 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIM2P55344 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIM2P55344 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIM2P55344 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIM2P55344 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIM2P55344 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIM2P55344 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIM2P55344 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIM2P55344 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIM2P55344 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIM2P55344 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIM2P55344 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIM2P55344 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIM2P55344 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LIM2P55344 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIM2P55344 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LIM2P55344 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LIM2P55344 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LIM2P55344 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LIM2P55344 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms