Protein–RNA interactions for Protein: P54821

PRRX1, Paired mesoderm homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1P54821 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRRX1P54821 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRRX1P54821 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRRX1P54821 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PRRX1P54821 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRRX1P54821 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRRX1P54821 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRRX1P54821 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRRX1P54821 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRRX1P54821 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRRX1P54821 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRRX1P54821 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRRX1P54821 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRRX1P54821 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRRX1P54821 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRRX1P54821 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRRX1P54821 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms