Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NUP98P52948 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NUP98P52948 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
NUP98P52948 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NUP98P52948 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NUP98P52948 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NUP98P52948 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NUP98P52948 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NUP98P52948 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NUP98P52948 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NUP98P52948 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NUP98P52948 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NUP98P52948 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
NUP98P52948 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
NUP98P52948 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NUP98P52948 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NUP98P52948 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NUP98P52948 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NUP98P52948 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NUP98P52948 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NUP98P52948 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NUP98P52948 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NUP98P52948 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NUP98P52948 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NUP98P52948 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NUP98P52948 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NUP98P52948 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NUP98P52948 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NUP98P52948 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NUP98P52948 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NUP98P52948 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NUP98P52948 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NUP98P52948 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
NUP98P52948 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NUP98P52948 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NUP98P52948 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NUP98P52948 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NUP98P52948 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NUP98P52948 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
NUP98P52948 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
NUP98P52948 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
NUP98P52948 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
NUP98P52948 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NUP98P52948 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NUP98P52948 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NUP98P52948 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NUP98P52948 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NUP98P52948 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
NUP98P52948 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NUP98P52948 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
NUP98P52948 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NUP98P52948 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NUP98P52948 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
NUP98P52948 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
NUP98P52948 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NUP98P52948 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
NUP98P52948 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NUP98P52948 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NUP98P52948 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NUP98P52948 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NUP98P52948 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NUP98P52948 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
NUP98P52948 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NUP98P52948 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NUP98P52948 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NUP98P52948 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NUP98P52948 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NUP98P52948 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NUP98P52948 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NUP98P52948 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NUP98P52948 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NUP98P52948 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NUP98P52948 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NUP98P52948 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NUP98P52948 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NUP98P52948 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NUP98P52948 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NUP98P52948 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NUP98P52948 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NUP98P52948 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NUP98P52948 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NUP98P52948 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NUP98P52948 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NUP98P52948 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NUP98P52948 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NUP98P52948 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NUP98P52948 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NUP98P52948 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NUP98P52948 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NUP98P52948 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUP98P52948 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUP98P52948 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUP98P52948 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUP98P52948 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUP98P52948 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
NUP98P52948 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUP98P52948 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUP98P52948 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUP98P52948 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUP98P52948 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms