Protein–RNA interactions for Protein: P40105

YRF1-2, Y' element ATP-dependent helicase protein 1 copy 2, yeastyeast

Predictions only

Length 1,681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-2P40105 YIL077CYIL077C 963 nt5.47□□□□□ -1.53
YRF1-2P40105 FUR1YHR128W 651 nt5.47□□□□□ -1.53
YRF1-2P40105 SEC39YLR440C 2130 nt5.46□□□□□ -1.54
YRF1-2P40105 YIL001WYIL001W 1542 nt5.46□□□□□ -1.54
YRF1-2P40105 YDR090CYDR090C 933 nt5.46□□□□□ -1.54
YRF1-2P40105 YIL152WYIL152W 708 nt5.46□□□□□ -1.54
YRF1-2P40105 CSR1YLR380W 1227 nt5.46□□□□□ -1.54
YRF1-2P40105 RPL18BYNL301C 561 nt5.46□□□□□ -1.54
YRF1-2P40105 MNT2YGL257C 1677 nt5.45□□□□□ -1.54
YRF1-2P40105 YER158CYER158C 1722 nt5.45□□□□□ -1.54
YRF1-2P40105 OCA4YCR095C 1089 nt5.45□□□□□ -1.54
YRF1-2P40105 YDR246W-AYDR246W-A 201 nt5.45□□□□□ -1.54
YRF1-2P40105 YAL047W-AYAL047W-A 330 nt5.45□□□□□ -1.54
YRF1-2P40105 YLR407WYLR407W 687 nt5.45□□□□□ -1.54
YRF1-2P40105 FRE3YOR381W 2136 nt5.45□□□□□ -1.54
YRF1-2P40105 YTA12YMR089C 2478 nt5.45□□□□□ -1.54
YRF1-2P40105 FLO8YER109C 2400 nt5.44□□□□□ -1.54
YRF1-2P40105 SGN1YIR001C 753 nt5.44□□□□□ -1.54
YRF1-2P40105 FLD1YLR404W 858 nt5.44□□□□□ -1.54
YRF1-2P40105 PPG1YNR032W 1107 nt5.44□□□□□ -1.54
YRF1-2P40105 LTV1YKL143W 1392 nt5.44□□□□□ -1.54
YRF1-2P40105 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt5.43□□□□□ -1.54
YRF1-2P40105 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt5.43□□□□□ -1.54
YRF1-2P40105 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt5.43□□□□□ -1.54
YRF1-2P40105 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt5.43□□□□□ -1.54
YRF1-2P40105 YHR032C-AYHR032C-A 120 nt5.43□□□□□ -1.54
YRF1-2P40105 ATF1YOR377W 1578 nt5.43□□□□□ -1.54
YRF1-2P40105 COX11YPL132W 903 nt5.43□□□□□ -1.54
YRF1-2P40105 MSK1YNL073W 1731 nt5.43□□□□□ -1.54
YRF1-2P40105 MSW1YDR268W 1140 nt5.43□□□□□ -1.54
YRF1-2P40105 EFB1YAL003W 621 nt5.43□□□□□ -1.54
YRF1-2P40105 BUD17YNR027W 954 nt5.43□□□□□ -1.54
YRF1-2P40105 AIM26YKL037W 357 nt5.42□□□□□ -1.54
YRF1-2P40105 PER33YLR064W 822 nt5.42□□□□□ -1.54
YRF1-2P40105 PEP5YMR231W 3090 nt5.41□□□□□ -1.54
YRF1-2P40105 MET17YLR303W 1335 nt5.41□□□□□ -1.54
YRF1-2P40105 YDL121CYDL121C 450 nt5.4□□□□□ -1.54
YRF1-2P40105 LOH1YJL038C 660 nt5.4□□□□□ -1.54
YRF1-2P40105 RFA2YNL312W 822 nt5.4□□□□□ -1.54
YRF1-2P40105 CCZ1YBR131W 2115 nt5.4□□□□□ -1.54
YRF1-2P40105 SDS3YIL084C 984 nt5.4□□□□□ -1.55
YRF1-2P40105 snR17bsnR17b 332 nt5.4□□□□□ -1.55
YRF1-2P40105 ROG3YFR022W 2202 nt5.39□□□□□ -1.55
YRF1-2P40105 RAD16YBR114W 2373 nt5.39□□□□□ -1.55
YRF1-2P40105 IMA3YIL172C 1770 nt5.39□□□□□ -1.55
YRF1-2P40105 IMA4YJL221C 1770 nt5.39□□□□□ -1.55
YRF1-2P40105 AXL2YIL140W 2472 nt5.38□□□□□ -1.55
YRF1-2P40105 VPS30YPL120W 1674 nt5.38□□□□□ -1.55
YRF1-2P40105 YIL021C-AYIL021C-A 270 nt5.38□□□□□ -1.55
YRF1-2P40105 YML116W-AYML116W-A 303 nt5.38□□□□□ -1.55
YRF1-2P40105 CDC4YFL009W 2340 nt5.38□□□□□ -1.55
YRF1-2P40105 UBP9YER098W 2265 nt5.38□□□□□ -1.55
YRF1-2P40105 HNT2YDR305C 654 nt5.37□□□□□ -1.55
YRF1-2P40105 HIS6YIL020C 786 nt5.37□□□□□ -1.55
YRF1-2P40105 EAR1YMR171C 1653 nt5.37□□□□□ -1.55
YRF1-2P40105 DBF4YDR052C 2115 nt5.37□□□□□ -1.55
YRF1-2P40105 SUM1YDR310C 3189 nt5.37□□□□□ -1.55
YRF1-2P40105 ILV5YLR355C 1188 nt5.37□□□□□ -1.55
YRF1-2P40105 ALT2YDR111C 1524 nt5.36□□□□□ -1.55
YRF1-2P40105 PDR15YDR406W 4590 nt5.36□□□□□ -1.55
YRF1-2P40105 YJR112W-AYJR112W-A 330 nt5.36□□□□□ -1.55
YRF1-2P40105 PGM2YMR105C 1710 nt5.36□□□□□ -1.55
YRF1-2P40105 SIP5YMR140W 1470 nt5.36□□□□□ -1.55
YRF1-2P40105 KRE6YPR159W 2163 nt5.35□□□□□ -1.55
YRF1-2P40105 MPS3YJL019W 2049 nt5.35□□□□□ -1.55
YRF1-2P40105 LHP1YDL051W 828 nt5.35□□□□□ -1.55
YRF1-2P40105 BAT2YJR148W 1131 nt5.35□□□□□ -1.55
YRF1-2P40105 ASI2YNL159C 870 nt5.35□□□□□ -1.55
YRF1-2P40105 TFC7YOR110W 1308 nt5.35□□□□□ -1.55
YRF1-2P40105 PUS7YOR243C 2031 nt5.34□□□□□ -1.55
YRF1-2P40105 PER1YCR044C 1074 nt5.34□□□□□ -1.55
YRF1-2P40105 YDL071CYDL071C 375 nt5.34□□□□□ -1.55
YRF1-2P40105 YJR038CYJR038C 363 nt5.34□□□□□ -1.55
YRF1-2P40105 YPL077CYPL077C 723 nt5.34□□□□□ -1.55
YRF1-2P40105 GLT1YDL171C 6438 nt5.34□□□□□ -1.55
YRF1-2P40105 HXT17YNR072W 1695 nt5.34□□□□□ -1.55
YRF1-2P40105 RRN3YKL125W 1884 nt5.34□□□□□ -1.55
YRF1-2P40105 YML031C-AYML031C-A 336 nt5.34□□□□□ -1.56
YRF1-2P40105 MRP21YBL090W 534 nt5.34□□□□□ -1.56
YRF1-2P40105 SLX1YBR228W 915 nt5.34□□□□□ -1.56
YRF1-2P40105 YEL020CYEL020C 1683 nt5.33□□□□□ -1.56
YRF1-2P40105 ENP1YBR247C 1452 nt5.33□□□□□ -1.56
YRF1-2P40105 YDR391CYDR391C 699 nt5.33□□□□□ -1.56
YRF1-2P40105 ZRT1YGL255W 1131 nt5.33□□□□□ -1.56
YRF1-2P40105 RPS0AYGR214W 759 nt5.33□□□□□ -1.56
YRF1-2P40105 CPA1YOR303W 1236 nt5.33□□□□□ -1.56
YRF1-2P40105 YDR193WYDR193W 399 nt5.32□□□□□ -1.56
YRF1-2P40105 SEC72YLR292C 582 nt5.32□□□□□ -1.56
YRF1-2P40105 HLJ1YMR161W 675 nt5.32□□□□□ -1.56
YRF1-2P40105 RAD4YER162C 2265 nt5.32□□□□□ -1.56
YRF1-2P40105 EUG1YDR518W 1554 nt5.32□□□□□ -1.56
YRF1-2P40105 HSP30YCR021C 999 nt5.31□□□□□ -1.56
YRF1-2P40105 RDN5-1RDN5-1 121 nt5.31□□□□□ -1.56
YRF1-2P40105 RDN5-6RDN5-6 121 nt5.31□□□□□ -1.56
YRF1-2P40105 VPS69YPR087W 321 nt5.31□□□□□ -1.56
YRF1-2P40105 snR7-SsnR7-S 179 nt5.31□□□□□ -1.56
YRF1-2P40105 AHA1YDR214W 1053 nt5.31□□□□□ -1.56
YRF1-2P40105 RNA15YGL044C 891 nt5.31□□□□□ -1.56
YRF1-2P40105 BUD13YGL174W 801 nt5.31□□□□□ -1.56
YRF1-2P40105 RAD52YML032C 1416 nt5.31□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 137.7 ms