Protein–RNA interactions for Protein: P33992

MCM5, DNA replication licensing factor MCM5, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM5P33992 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MCM5P33992 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MCM5P33992 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MCM5P33992 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MCM5P33992 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MCM5P33992 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MCM5P33992 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MCM5P33992 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MCM5P33992 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MCM5P33992 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MCM5P33992 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MCM5P33992 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MCM5P33992 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MCM5P33992 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MCM5P33992 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MCM5P33992 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MCM5P33992 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MCM5P33992 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MCM5P33992 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MCM5P33992 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MCM5P33992 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MCM5P33992 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MCM5P33992 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MCM5P33992 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MCM5P33992 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MCM5P33992 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MCM5P33992 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MCM5P33992 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MCM5P33992 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MCM5P33992 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MCM5P33992 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MCM5P33992 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MCM5P33992 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MCM5P33992 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MCM5P33992 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
MCM5P33992 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MCM5P33992 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MCM5P33992 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MCM5P33992 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MCM5P33992 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MCM5P33992 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MCM5P33992 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MCM5P33992 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MCM5P33992 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
MCM5P33992 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MCM5P33992 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MCM5P33992 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MCM5P33992 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MCM5P33992 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MCM5P33992 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MCM5P33992 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MCM5P33992 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
MCM5P33992 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MCM5P33992 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MCM5P33992 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MCM5P33992 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MCM5P33992 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MCM5P33992 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MCM5P33992 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MCM5P33992 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MCM5P33992 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MCM5P33992 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MCM5P33992 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MCM5P33992 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MCM5P33992 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MCM5P33992 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MCM5P33992 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MCM5P33992 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MCM5P33992 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MCM5P33992 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MCM5P33992 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MCM5P33992 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
MCM5P33992 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
MCM5P33992 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MCM5P33992 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MCM5P33992 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MCM5P33992 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MCM5P33992 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MCM5P33992 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MCM5P33992 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MCM5P33992 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MCM5P33992 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MCM5P33992 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MCM5P33992 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MCM5P33992 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MCM5P33992 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MCM5P33992 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MCM5P33992 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MCM5P33992 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MCM5P33992 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MCM5P33992 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MCM5P33992 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MCM5P33992 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MCM5P33992 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MCM5P33992 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MCM5P33992 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MCM5P33992 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MCM5P33992 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MCM5P33992 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MCM5P33992 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms